| 桉树焦枯病菌SIT转运蛋白的鉴定与表达 |
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| 引用本文： | 刘宏毅,陈慧洁,李慧敏,等.桉树焦枯病菌SIT转运蛋白的鉴定与表达[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2018,46(11):18-24. |
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| 作者姓名： | 刘宏毅 陈慧洁 李慧敏 等 |
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| 作者单位： | 福建农林大学 林学院,福建农林大学 林学院,福建农林大学 林学院 |
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| 基金项目： | 福建省财政厅项目（K81139238，K8113001A）；福建农林大学科技创新专项（KFA17053A） |
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| 摘 要： | 【目的】揭示SIT转运蛋白家族在焦枯病菌铁元素摄入机制,以及铁载体-铁转运蛋白在焦枯病菌侵染桉树过程中所扮演的角色。【方法】采用HMMER软件对焦枯病菌SIT转运蛋白进行鉴定,并用InterPro、TMHMM、TCDB数据库等的在线服务对焦枯病菌SIT转运蛋白的结构域、跨膜螺旋和功能进行预测,用MEGA7.0软件进行多菌种比较分析,最后采用qPCR对焦枯病菌侵染桉树48h时SIT基因的转录表达情况进行验证。【结果】桉树焦枯病菌共含有16个SIT转运蛋白,约占总编码蛋白的0.11%,主要分为铁-铁载体转运蛋白、铁载体-铁:H+同向转运蛋白和铁载体-铁转运蛋白;亚细胞定位预测结果显示,除预测CpSit13转运蛋白位于内质网上外,其余均在细胞膜上。桉树焦枯病菌SIT转运蛋白的序列长度为400～603aa,其结构域均为MFS结构域,跨膜螺旋为10～14个。基因表达谱分析显示,有10个SIT基因上调表达,有2个下调表达,有4个表达不显著。其中CpSit1、CpSit5、CpSit8、CpSit14和CpSit16相对分支中其他基因具有较高的转录量。qPCR验证结果与基因表达谱具有较高的一致性。【结论】CpSit1、CpSit5、CpSit8、CpSit14和CpSit16基因在焦枯病菌侵染桉树过程中具有较为重要的作用。
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| 关 键 词： | 桉树 焦枯病菌 SIT蛋白 生物信息学 转录表达 |
| 收稿时间： | 2017/8/14 0:00:00 |
Identification and expression of Siderophore-iron transporter in Calonectria pseudoreteaudii |
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| LIU Hongyi,CHEN Huijie and LI Huimin,et al.Identification and expression of Siderophore-iron transporter in Calonectria pseudoreteaudii[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2018,46(11):18-24. |
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| Authors: | LIU Hongyi CHEN Huijie and LI Huimin |
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| Abstract: | |
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