| 猪博卡病毒1型nPCR检测方法的建立与\=SXWN20株基因序列分析 |
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| 引用本文： | 朱小甫,吴旭锦,郑红青,尹宝英,熊忙利,张文娟,张兆顺.猪博卡病毒1型nPCR检测方法的建立与\=SXWN20株基因序列分析[J].陕西农业科学,2022(11):82-86. |
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| 作者姓名： | 朱小甫 吴旭锦 郑红青 尹宝英 熊忙利 张文娟 张兆顺 |
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| 作者单位： | （咸阳职业技术学院，咸阳市动物疫病分子生物学诊断技术研究重点实验室，陕西 咸阳 712000） |
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| 摘 要： | 建立了检测猪博卡病毒1型（PBoV）的nPCR方法，对陕西省部分猪群PBoV1型感染情况进行流行病学调查。通过优化反应体系与条件，测试了方法的灵敏性和特异性，建立了PBoV1型nPCR检测方法，并对阳性样品进行测序分析。结果表明，建立nPCR方法检测PBoV1型单链DNA的极限为4.742×10-2 ng/μL，该方法与PCV2、PCV3、PPV、猪链球菌和猪大肠杆菌DNA均无交叉反应，特异性良好。检测了陕西省猪场60份样品，PBoV1型阳性率为3.33%（2/60）。测序获得的SXWN20株VP1/VP2基因序列比对发现，SXWN20株与参比的PBoV1型毒株核苷酸同源性为96.6%~97.5%，与PBoV2/3/4/5型JP]同源性仅为53.8%~59.7%。进化树分析显示，所有参比毒株分为3个大分支，SXWN20株与PBoV1型毒株处在一个进化分支，PBoV2型处在一个进化分支，PBoV3/4/5型处在一个进化分支。
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| 关 键 词： | 猪博卡病毒 核酸检测 序列分析 聚合酶链式反应 |
Construction of An nPCR Detection Method for Porcine Boca Virus Type 1 and Gene Sequence Analysis of SXWN20 Strain |
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| ZHU Xiaofu,WU Xujin,ZHENG Hongqing,YIN Baoying,XIONG Mangli,ZHANG Wenjuan,ZHANG Zhaoshun.Construction of An nPCR Detection Method for Porcine Boca Virus Type 1 and Gene Sequence Analysis of SXWN20 Strain[J].Shaanxi Journal of Agricultural Sciences,2022(11):82-86. |
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| Authors: | ZHU Xiaofu WU Xujin ZHENG Hongqing YIN Baoying XIONG Mangli ZHANG Wenjuan ZHANG Zhaoshun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Porcine boca virus Nucleic acid testing Sequence analysis PCR |
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