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| 猕猴桃EST序列的SSR信息分析 | |
| 作者姓名： | 姜春芽 徐小彪 廖 娇 倪志华 李 晶 |
| 作者单位： | 江西农业大学农学院,江西南昌,330045 ? |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目? |
| 摘 要： | 研究目的]通过筛查猕猴桃EST数据库中的SSR重复序列,可为开发出新型的猕猴桃EST-SSR标记和分子生物学研究奠定理论基础;方法]从NCBI公共数据库中最新公布的猕猴桃表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)中随机抽取56400条序列,应用SSRHtmter软件查找微卫星(Microsatellite,SSR)重复序列;结果]研究结果表明,从猕猴桃EST序列中获得了7939条SSR,其中包括二核苷酸重复5131条(64.63%),三核苷酸重复1237条(15.58%),四核苷酸重复284条(3.58%),五核苷酸重复397条(5.00%),六核苷酸重复890条(11.2l%).在二核苷酸重复序列中,AG/CT共分布4654条(90.70%).大约每2.48 kb长度的单一基因序列中即存在1个SSR,即平均7个单一基因中存在1个SSR;结论]在猕猴桃EST序列中,二核苷酸重复序列是最丰富的重复单元,其次为三核苷酸重复和六核苷酸重复.在所获得的SSR重复单元中,AG/CT为优势重复. |
| 关 键 词： | 猕猴桃 表达序列标签 微卫星 |
Analysis of SSR Information in EST Resources of Kiwifruit (Actinidia ssp.) |
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| Authors: | Jiang Chuny Xu Xiaobiao Liao Jiao Ni Zhihu Li Jing |
| Abstract: | |
| Keywords: | Kiwifruitzz ESTzz SSRzz |
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