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白刺14-3-3基因家族的鉴定及表达分析
引用本文:易丹,王博,段慧荣,李毅,王丽蓉.白刺14-3-3基因家族的鉴定及表达分析[J].草地学报,2021,29(3):443-456.
作者姓名:易丹  王博  段慧荣  李毅  王丽蓉
作者单位:1. 甘肃农业大学林学院, 甘肃 兰州 730070;2. 青海民族大学, 青海 西宁 810000;3. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所, 甘肃 兰州 730050
基金项目:甘肃省林业科技创新与国际合作资金;中央财政林业科技推广示范资金;青海民族大学校级高层次人才项目;国家自然科学基金;甘肃省科技创新基地与人才计划;"丝绸之路"草原生态修复技术模式研究;示范,对发展中国家常规性科技援助项目
摘    要:为探明白刺(Nitraria tangutorum)14-3-3基因家族的基本特征及其进化关系,本研究基于白刺转录组数据,利用生物信息学方法,对白刺14-3-3基因家族成员进行鉴定,预测其理化性质、亚细胞定位、保守结构域,分析其系统进化关系及其基因在不同浓度盐、干旱处理下的组织器官表达模式。结果表明:从白刺转录组数据中初步筛选出10个14-3-3家族成员,其中具有完整蛋白质编码区(Coding Sequence,CDS)的9个成员,其蛋白的编码氨基酸的数目为212~297个,等电点在4.73~6.14之间,分子量范围是24.06~33.51 kDa,二级结构主要以α螺旋为主,三级结构高度保守;亚细胞定位预测显示该家族成员主要分布在细胞质上;表达模式分析表明,14-3-3基因在白刺不同组织器官中呈现不同的表达规律,且参与应答外界的干旱和盐胁迫。由此推测,14-3-3基因家族可能在白刺的胁迫防御方面发挥重要功能。本研究结果为进一步深入揭示白刺14-3-3基因家族的功能奠定基础。

关 键 词:14-3-3基因家族  白刺  生物信息学  表达模式  
收稿时间:2020-10-21

Identification and Expression Analysis of 14-3-3 Gene Family in Nitraria tangutorum
YI Dan,WANG Bo,DUAN Hui-rong,LI Yi,WANG Li-rong.Identification and Expression Analysis of 14-3-3 Gene Family in Nitraria tangutorum[J].Acta Agrestia Sinica,2021,29(3):443-456.
Authors:YI Dan  WANG Bo  DUAN Hui-rong  LI Yi  WANG Li-rong
Institution:1. College of Forestry, Gansu Agricultural University, Lanzhou, Gansu Provicne 730070, China;2. Qinghai University for Nationalities, Xining, Qinghai Provicne 810000, China;3. Lanzhou Institute of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou, Gansu Provicne 730050, China
Abstract:
Keywords:14-3-3 gene family  Nitraria tangutorum  Bioinformatics  Expression pattern
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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