| 摘 要： | 本研究基于毛蚶(Scapharca subcrenata)的转录组数据，利用MISA软件对其中的微卫星位点进行挖掘。从35 555条unigene中共获得3987个SSR，SSR出现频率达11.21%。SSR重复类型主要以二核苷酸重复为主(58.06%)，其次为三核苷酸重复(19.04%)。共有182种重复基元，不同类型SSR的重复基元分布特征不同，其中，二核苷酸重复基元中AC/GT类型比例最高，为45.70%。毛蚶转录组中SSR重复次数主要集中在5~7次，SSR长度主要集中在12~29 bp，多态性均在中等以上。利用筛选出的14对SSR引物在山东潍坊毛蚶野生群体中进行遗传多样性分析，结果显示，平均有效等位基因数(Na)、平均观测杂合度(Ho)、平均期望杂合度(He)和多态性信息含量(PIC)分别为15.4、0.682、0.852和0.817，从PIC值来看，本研究开发的14个微卫星标记均属高多态性标记(PIC≥0.5)。此外，有7个位点显著偏离哈迪–温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE) (P<0.05)。结果表明，基于毛蚶转录组数据开发微卫星标记是切实可行的，研究结果丰富了毛蚶的分子标记数量，对毛蚶的种群遗传学分析、遗传图谱构建及分子辅助育种等研究具有重要意义。
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