| 日本落叶松杂种及亲本 4CL基因的克隆和SNP多态性分析 |
| |
| 引用本文： | 周亚楠,李爱,陈成彬,王春国,宋文芹.日本落叶松杂种及亲本 4CL基因的克隆和SNP多态性分析[J].林业科学研究,2013,26(S1):18-24. |
| |
| 作者姓名： | 周亚楠 李爱 陈成彬 王春国 宋文芹 |
| |
| 作者单位： | 南开大学生命科学学院, 天津 300071;南开大学生命科学学院, 天津 300071;天津农学院园艺系, 天津 300384;南开大学生命科学学院, 天津 300071;南开大学生命科学学院, 天津 300071;南开大学生命科学学院, 天津 300071 |
| |
| 基金项目： | 国家"973"计划项目(2009CB119105);天津市自然科学基金(13JCZDJC29000) |
| |
| 摘 要： | 以日本落叶松(Larix kaempferi)不同杂交组合为材料,依据转录组测序信息,成功获得了11种日本落叶松材料的4 CL基因的编码区序列,该序列长1 537 bp,包含完整ORF片段1 368 bp,编码455个氨基酸。qRT-PCR结果分析表明,除日本落叶松Larix16×Larix61组合外,Larix82×Larix13、Larix40×Larix10和Larix82×Larix61子代的表达均高于双亲,推测4 CL基因差异表达与落叶松杂种的木质素生物合成有关。进一步采用SNP标记方法和DNAMAN软件对不同日本落叶松杂种和亲本组合的单核苷酸多态性进行分析。共检测到66个SNP多态性位点,表明日本落叶松4CL 具有丰富的遗传多样性。66个SNP变异中,属于三突变1个;转换类型45个,占总变异的68.18%;20个属于颠换类型,占总变异的30.30%,转换:颠换=9:4。在转换类型中,A/G和C/T转换分别占28.79%和39.39%;颠换类型中A/C、A/T、G/C、G/T分别占4.55%、9.09%、9.09%和7.58%。采用NJ 聚类法对克隆片段的氨基酸序列进行了遗传多样性分析。
|
| 关 键 词： | 日本落叶松 4CL基因 SNP 差异表达 |
| 收稿时间： | 2013/8/19 0:00:00 |
Cloning and SNP Analysis of 4CL Gene in Larix kaempferi Hybrids and Their Parent Lines |
| |
| ZHOU Ya-nan,LI Ai,CHEN Cheng-bin,WANG Chun-guo and SONG Wen-qin.Cloning and SNP Analysis of 4CL Gene in Larix kaempferi Hybrids and Their Parent Lines[J].Forest Research,2013,26(S1):18-24. |
| |
| Authors: | ZHOU Ya-nan LI Ai CHEN Cheng-bin WANG Chun-guo and SONG Wen-qin |
| |
| Institution: | College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China;College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China;Department of Horticulture, Tianjin Agricultural University, Tianjin 300384, China;College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China;College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China;College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Larix kaempferi 4CL gene single nucleotide polymorphisms (SNP) differential expression |
|
| 点击此处可从《林业科学研究》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《林业科学研究》下载免费的PDF全文 |
|
