| 草鱼MKLN1基因可变剪接和微卫星序列的多态性 |
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| 引用本文： | 徐冰,徐义平,鲍宝龙.草鱼MKLN1基因可变剪接和微卫星序列的多态性[J].上海水产大学学报,2011(5). |
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| 作者姓名： | 徐冰 徐义平 鲍宝龙 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室;浙江省乐清市海洋与渔业局; |
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| 基金项目： | 上海市教育委员会重点学科建设项目(S30701和J50701) |
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| 摘 要： | MKLN1基因编码的muskelin蛋白主要通过其羧基端的kelch重复结构域与其它蛋白形成复合物行使功能。通过分析草鱼鳃组织的基因转录谱,发现其中的MKLN1基因存在(CT)15的微卫星序列,通过检测3个不同的草鱼种群,又发现(CT)9、(CT)10、(CT)11和(CT)13 4种多态性序列。通过克隆该段MKLN1基因组序列并与斑马鱼和红鳍东方鲀的MKLN1基因组序列比较,发现克隆得到的草鱼基因序列是由一个内含子和两个外显子组成,共编码144个氨基酸。通过进一步调查不同组织该基因的转录本,发现存在内含子剪接和内含子未被剪接的两个转录本。由于内含子序列未被剪接的转录本在内含子中存在TGA终止密码子,导致MKLN1基因翻译提前终止,翻译产物为失去部分kelch结构域的muskelin蛋白。相对于内含子正常剪接的转录本,没有被剪接内含子的转录本在各种组织中的表达量要明显低得多。简而言之,本研究发现了草鱼MKLN1转录本中的微卫星序列是来自未被剪切的内含子,而未被剪切的内含子导致该转录本编码部分kelch结构域缺失的muskelin蛋白。研究亮点:目前对于可直接锚定功能基因的I型微卫星标记研究很少。本文首次发现M...
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| 关 键 词： | 草鱼 MKLN1 微卫星多态性 可变剪接 |
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