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用RAPD及mtDNA D-loop区序列揭示长江下游长春鳊遗传多样性
引用本文:李建林,唐永凯,俞菊华.用RAPD及mtDNA D-loop区序列揭示长江下游长春鳊遗传多样性[J].上海水产大学学报,2008,17(2):145-151.
作者姓名:李建林  唐永凯  俞菊华
作者单位:中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,江苏无锡214081
基金项目:科技部科技基础条件平台建设计划
摘    要:应用RAPD和mtDNA D-loop区序列对长江下游长春鳊群体的遗传多样性进行分析.从40个随机引物中筛选出扩增条带清晰的28个引物,对24尾采自长江下游常熟江段长春鳊的基因组DNA进行扩增,共检测到178个位点,扩增片段大小在0.2~2 kb之间,其中多态位点有83个,占46.63%;个体间最大的遗传距离为0.132 6,最小的遗传距离为0.047 6,平均遗传距离为0.088 5;群体的Shannon多样性指值为0.098 6.RAPD结果表明该长春鳊群体的遗传多样性处于中等水平.对其中8尾长春鳊mtDNA D-loop区序列(938 bp)进行了分析,发现了8种单倍型,检测出17个多态性核苷酸变异位点,多态位点比例为1.81%,变异位点为15个转换,2个颠换;单倍型多态性(h)为1.000,核苷酸多态性(pi)为0.006 2,平均核苷酸差异数(K)为5.821,单倍型间平均遗传距离为0.006 3.结果说明长春鳊mtDNA D-loop区在个体间的遗传差异较小.

关 键 词:长春鳊  RAPD  线粒体DNA控制区  遗传多样性  RAPD  analysis  mtDNA  序列  长江  长春  遗传多样性  sequences  mitochondrial  the  Yangtze  River  lower  reaches  diversity  遗传差异  转换  多态位点比例  变异位点  核苷酸  多态性  单倍型  发现  水平
文章编号:1004-7271(2008)02-0145-07
修稿时间:2007年6月27日

Genetic diversity in Parabramis pekinensis from the lower reaches of the Yangtze River from RAPD analysis and mitochondrial D-loop sequences
LI Jian-lin,TANG Yong-kai,YU Ju-hua.Genetic diversity in Parabramis pekinensis from the lower reaches of the Yangtze River from RAPD analysis and mitochondrial D-loop sequences[J].Journal of Shanghai Fisheries University,2008,17(2):145-151.
Authors:LI Jian-lin  TANG Yong-kai  YU Ju-hua
Abstract:
Keywords:
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