| 大豆耐涝bHLH转录因子筛选及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 林延慧,徐冉,朱红林,唐力琼,侯本军,徐靖.大豆耐涝bHLH转录因子筛选及生物信息学分析[J].大豆科学,2021,40(3):319-326. |
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| 作者姓名： | 林延慧 徐冉 朱红林 唐力琼 侯本军 徐靖 |
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| 作者单位： | 海南省农业科学院粮食作物研究所/海南省农作物遗传育种重点实验室/农业部作物基因资源与种质创制海南科学观测实验站,海南海口571100;山东省农业科学院作物研究所,山东济南250100 |
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| 摘 要： | 为研究大豆bHLH转录因子与涝害响应相关性,为大豆耐涝性研究提供理论基础,本研究对强耐涝性品种齐黄34进行没顶淹水处理,分析转录组测序结果,筛选差异表达的bHLH转录因子并对其进行生物信息学分析,采用荧光定量PCR方法验证主要差异表达bHLH转录因子编码基因的表达情况,并通过生物信息学方法分析基因结构和互作蛋白.结果 显示:涝害胁迫下共发现7个差异表达的bHLH转录因子,它们的同源性并不高,属于不同类型的bHLH.主要差异表达bHLH基因GmbHLH25-15(Glyma.15 G06680)的表达量变化情况与转录组数据趋势一致,呈现下调表达.预测到10个蛋白可与该蛋白互作,互作蛋白都是铵转运蛋白,其中4个蛋白编码基因的表达量在转录组测序结果中呈现显著性差异.推测在无氧条件下,GmbHLH25-15可能通过调控铵转运蛋白进而调节铵态氮的吸收来供给自身营养,进而抵御涝害胁迫.
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| 关 键 词： | 大豆 耐涝 转录组 bHLH转录因子 GmbHLH25-15 铵转运蛋白 |
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