| 矮牵牛涝渍胁迫相关ERF转录因子筛选与鉴定 |
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| 引用本文： | 王月悦,赵安琪,刘翔,董婷婷,尹冬梅.矮牵牛涝渍胁迫相关ERF转录因子筛选与鉴定[J].分子植物育种,2024(4):1103-1113. |
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| 作者姓名： | 王月悦 赵安琪 刘翔 董婷婷 尹冬梅 |
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| 作者单位： | 上海应用技术大学生态技术与工程学院 |
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| 摘 要： | ERF转录因子是植物特有的一类转录因子，属于AP2/ERF转录因子家族，调控多种生物学功能，在植物响应生物与非生物胁迫过程中起到重要作用。本研究选取矮牵牛PhERF2过表达株系(I)、RNA干扰株系(4B)为实验材料，以野生型(WT)为对照，基于涝渍处理0、3 h的转录组测序技术(RNA-Seq)获得差异表达基因数据，利用生物信息学方法分析保守基序及蛋白理化性质、构建系统进化树、进行蛋白高级结构建模、磷酸化修饰位点预测和亚细胞定位分析。结果显示，共筛选出35个涝渍胁迫相关ERF转录因子，均属于AP2亚族，通过与拟南芥及水稻相关基因进行系统进化分析，发现矮牵牛与拟南芥同源性较高。生物信息学分析表明，矮牵牛涝渍胁迫相关ERF转录因子富含酸性氨基酸，热稳定性较高且均属于亲水性蛋白，蛋白二级结构以无规则卷曲为主要组成部分，蛋白质三级结构差异不明显，含有3个保守基序，大多数NAC蛋白定位于细胞核，均含有潜在的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化位点。本研究为后续探究矮牵牛涝渍胁迫相关ERF基因功能提供一定基础。
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| 关 键 词： | 矮牵牛 ERF转录因子 涝渍胁迫 生物信息学 |
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