| 猪流行性腹泻病毒湖北株的分离鉴定及其s1基因进化分析 |
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| 引用本文： | 桂锐,郭锐,田永祥,李文浩,蔡行,段正赢,杨克礼,刘泽文,袁芳艳.猪流行性腹泻病毒湖北株的分离鉴定及其s1基因进化分析[J].湖北农业科学,2016(6):1506-1510. |
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| 作者姓名： | 桂锐 郭锐 田永祥 李文浩 蔡行 段正赢 杨克礼 刘泽文 袁芳艳 |
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| 作者单位： | 1. 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,武汉430064;华中农业大学动物医学院,武汉430070;2. 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室,武汉,430064 |
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| 基金项目： | 中国农业科学院哈尔滨兽医生物技术国家重点实验室开放基金项目(SKLVBF201513)，湖北省自然科学基金重点项目(2014CFA106)，湖北省农业科学院青年基金项目(2014NKYJJ09)，湖北省科技支撑计划(公益性课题)项目(2014BBB010)，湖北省农业科技创新中心项目(2011-620-001-003) |
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| 摘 要： | 猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)是猪的肠道传染病病原,主要引起仔猪呕吐、腹泻和脱水,对一周龄内的哺乳仔猪危害最为严重,死亡率可达50%~100%。利用Vero86细胞从湖北某猪场腹泻仔猪小肠病料中分离到一株病毒,经RT-PCR检测、序列比对后确定其为PEDV,命名为HB201503株。设计PEDV s1基因的全长扩增引物,获得该株病毒的s1基因全长序列并进行了进化分析,结果表明该毒株与近年来在Gen Bank登陆的PEDV s1基因核苷酸序列相似性在91.4%~99.2%,与疫苗株CV777相似性较低,仅为91.8%。通过s1基因进化树分析表明HB201503以及近几年国内分离毒株主要集中在第I个亚群,且HB201503株与KM406183(2014,四川)和KM609206(2015,江苏)同源性较高。此外,s1蛋白氨基酸序列比对显示,HB201503与近几年分离毒株及疫苗株CV777均在55-74、157-163位氨基酸出现了连续4个以上氨基酸的缺失或替换,而且HB201503株与CV777及近几年分离毒株相比,还在270-283位氨基酸上出现了1个氨基酸的缺失和10个氨基酸的替换。
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus PEDV) 分离鉴定 s1基因 进化分析 |
Phylogenetic Analysis of s1 Gene from a Newly Isolated Strain of Porcine Epidemic Diarrhea Virus |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Porcine epidemic diarrhea virus isolation and identification s1 gene phylogenetic analysis |
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