| 海南原鸡CDC42 cDNA的克隆及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张珈宁,荣辉,杜丽,贾晓晓,史巧芸,郭莳雨,吴科榜,王学梅,王凤阳.海南原鸡CDC42 cDNA的克隆及其生物信息学分析[J].中国家禽,2012,34(21). |
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| 作者姓名： | 张珈宁 荣辉 杜丽 贾晓晓 史巧芸 郭莳雨 吴科榜 王学梅 王凤阳 |
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| 作者单位： | 海南大学农学院,海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室,海口市动物基因工程重点实验室,海南海口 570228 |
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| 基金项目： | 海南省重点科技项目，海南省自然科学基金项目 |
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| 摘 要： | 以海南原鸡外周血白细胞总RNA为模板,利用RT-PCR技术,扩增海南原鸡细胞分裂周期蛋白42(Cell division cycle 42,CDC42)编码区,将扩增产物与pMDTM20T载体连接,重组质粒鉴定正确后,进行序列特征、同源性、编码蛋白质理化性质及结构预测等生物信息学分析.结果表明,海南原鸡CDC42的CDS序列长度为576 bp,编码191个氨基酸；与鸡、人、牛、褐家鼠、斑马鱼的核苷酸序列同源性分别为100％、88.54％、88.19％、86.98％、82.12％；该基因编码的蛋白质相对分子质量约为21 259,理论等电点为6.16；编码蛋白为非跨膜蛋白,在其二级结构中,α-螺旋占27.23％,β-折叠占25.65％,无规卷曲占47.12％.
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| 关 键 词： | 海南原鸡 CDC42 克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of CDC42 cDNA from Hainan Junglefowl |
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| ZHANG Jianing
,
RONG Hui
,
DU Li
,
JIA Xiaoxiao
,
SHI Qiaoyun
,
GUO Shiyu
,
WU Kebang
,
WANG Xuemei
,
WANG Fengyang.Cloning and Bioinformatics Analysis of CDC42 cDNA from Hainan Junglefowl[J].China Poultry,2012,34(21). |
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| Authors: | ZHANG Jianing RONG Hui DU Li JIA Xiaoxiao SHI Qiaoyun GUO Shiyu WU Kebang WANG Xuemei WANG Fengyang |
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