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小金海棠缺铁胁迫相关miR394a的克隆与表达分析
引用本文:于昌江,孙瑞,王忆,张新忠,韩振海.小金海棠缺铁胁迫相关miR394a的克隆与表达分析[J].中国农学通报,2012,28(28):158-162.
作者姓名:于昌江  孙瑞  王忆  张新忠  韩振海
作者单位:中国农业大学园艺植物研究所/北京市果树逆境生理与分子生物学重点实验室,北京100193
基金项目:863苹果分子育种与种质创新(2011AA001204); 苹果产业技术体系(CARS-28)
摘    要:为了研究铁高效植物小金海棠的miRNAs信息及在缺铁处理下miRNA的表达变化,以进一步了解小金海棠缺铁分子调控机制。以改良CTAB法提取的总RNA为模板,从小金海棠中分离得到miR394a。通过Real-time PCR检测miR394a的表达,并利用生物信息学方法预测了miR394a的靶基因及其功能。miR394a具有高度保守性,从小金海棠中分离的miR394a与其他物种的miR394a序列高度相似。缺铁胁迫后,小金海棠的miR394a在根及叶中都有表达,但表达模式有所不同,miR394a在根部响应较为迅速,缺铁处理1天时,即有上调表达;而在叶片的响应较晚,缺铁3天时有上调表达。miR394a的靶基因预测表明,miR394a主要调控转录因子及参与代谢途径的基因。结果表明,miR394a受缺铁胁迫所诱导,参与了小金海棠缺铁调控途径,在缺铁调控中起重要作用。

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收稿时间:2012/5/16 0:00:00
修稿时间:2012/6/18 0:00:00

Cloning and expression analysis of miR394a under iron deficiency in Malus xiaojinensis
Yu Changjiang,Sun Rui,Wang Yi,Zhang Xinzhong,Han Zhenhai.Cloning and expression analysis of miR394a under iron deficiency in Malus xiaojinensis[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2012,28(28):158-162.
Authors:Yu Changjiang  Sun Rui  Wang Yi  Zhang Xinzhong  Han Zhenhai
Institution:(Institute for Horticulture Plants, China Agricultural University/ The Key Laboratory of Beijing Municipality of Stress Physiology and Molecular Biology for Fruit Tree, Beijing 100193)
Abstract:
Keywords:mieroRNA  Malus xiaojinensis  real-time PCR  iron deficiency
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