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甜瓜GRAS家族全基因组的鉴定与表达分析
引用本文:郑玲,闫晓曼.甜瓜GRAS家族全基因组的鉴定与表达分析[J].江苏农业科学,2023(11):53-59.
作者姓名:郑玲  闫晓曼
作者单位:洛阳师范学院生命科学学院
摘    要:为了研究甜瓜(Cucumis melo L.)GRAS基因家族的结构特征、进化模式和生长发育过程中的表达模式,对甜瓜GRAS全基因组的基本信息、染色体位置、共线性、系统发育树、基因结构、表达模式、顺式元件进行了全面分析。结果表明,从甜瓜中鉴定出37个GRAS基因;这些基因在甜瓜的11条染色体上呈不均匀分布,并在6、7、8号染色体上出现串联重复;甜瓜GRAS家族可分为HAM、LS、SCR、SCL3、DELLA、LISCL、SHR、PAT1 8个亚族;基因结构分析显示,含有1~3个内含子的基因有8个,没有内含子的基因有29个;启动子分析,鉴定到生长素、脱落酸、赤霉素、低温、干旱、光信号响应作用元件以及参与分生组织和胚乳表达的元件;表达模式分析结果表明,HAM、DELLA亚族的基因几乎在所有组织中都有表达,LS亚族在根和茎中表达含量较高,PAT1亚族在甜瓜的整个生长发育过程中发挥着重要作用。得出结论,甜瓜全基因组共获得GRAS基因37个,共可分为8个亚族,不同的亚族具有不同的基因结构、蛋白质结构和表达模式;不同亚族在甜瓜生长发育的不同阶段具有差异性表达,它们共同参与调控甜瓜的发育过程。

关 键 词:甜瓜  GRAS家族  生物信息学  表达模式
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