| 高温胁迫下2个棉花品种转录组可变剪切差异分析 |
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| 引用本文： | 丁宇,王马寅,唐敏强,李子阳,谢尚潜.高温胁迫下2个棉花品种转录组可变剪切差异分析[J].江苏农业科学,2023(5):1-11. |
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| 作者姓名： | 丁宇 王马寅 唐敏强 李子阳 谢尚潜 |
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| 作者单位： | 海南大学 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(编号：32060149、31760316)；;海南省自然科学基金(编号：320RC500、321RC469)； |
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| 摘 要： | 棉花(Gossypium hirsutum L.)是一种重要的经济作物，是世界上第二大的天然纺织纤维来源和重要的食用油来源。棉花对生物和非生物胁迫高度敏感，尤其是高温胁迫极易影响花粉的活力和花药的开裂。为了解析棉花在高温胁迫下基因转录水平的相应变化机制，开展了热敏和耐热2个棉花品种的全长转录组响应高温胁迫处理变化的研究。通过转录本的可变剪切分析发现，2个棉花品种在高温胁迫下可变剪切的总数显著增加。热敏品种Che61-72中发现了2 900个差异表达基因，并且差异基因在加热前样本(R0)和加热12 h后的样本(R12)中分别识别到了13 251个和25 296个可变剪切事件，其中内含子保留事件增加得最多，有3 837个。耐热品种新陆早36号中发现了2 437个差异表达基因，在加热前样本(T0)和加热12 h后的样本(T12)中鉴定到了11 248个和13 769个可变剪切事件，外显子跳跃事件变化得最大，增加了4 144个。富集分析发现，2个品种的差异基因都显著富集到了光系统Ⅰ的光捕获、叶绿体类囊体膜和光合作用-天线蛋白通路中，并筛选出5个关键基因(CPB3、A0A1U8IZF2、A0A1...
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| 关 键 词： | 棉花 高温胁迫 全长转录组 纳米孔测序 可变剪切 |
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