枸杞实时荧光定量RT-qPCR内参基因筛选与验证 |
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引用本文: | 李浩霞,黄稳娥,柳西宁,朱馨蕾,任晓月,安巍,周军,赵建华.枸杞实时荧光定量RT-qPCR内参基因筛选与验证[J].江苏农业科学,2023(9):41-51. |
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作者姓名: | 李浩霞 黄稳娥 柳西宁 朱馨蕾 任晓月 安巍 周军 赵建华 |
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作者单位: | 1. 宁夏农林科学院林业与草地生态研究所;2. 宁夏农林科学院枸杞科学研究所/国家枸杞工程技术研究中心;3. 北方民族大学生物科学与工程学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(编号:32060359);;宁夏自然科学创新群体基金(编号:2021AAC01001); |
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摘 要: | 以9种不同基因型枸杞的不同组织(茎、叶、花、果)和不同发育期(FS1~FS5)的果实为试材,选取Act-1/Act-3、Ef1a、Gapdh、H3b、Acx4、Pp2a、Rh37、Samc、Tub为候选内参基因,利用实时荧光定量技术(RT-qPCR)检测了9个候选基因在不同基因型枸杞的不同组织和不同发育阶段果实中的表达水平。并采用geNorm、NormFinder、BestKeeper、Delta Ct、RefFinder分析方法,评估候选内参基因的表达稳定性,并选择Beat基因验证内参基因。结果表明,Ef1a为不同基因型枸杞的不同组织和5个发育时期果实中表达较稳定的内参基因,Gapdh为表达最不稳定的内参基因;在宁夏枸杞中表达最稳定的内参基因为Rh37,其次为Ef1a。进一步采用Beat基因对不同基因型枸杞的不同组织(茎、叶、花、果)和5个发育时期果实中的表达模式进行验证,表明Ef1a、Act-1基因可作为枸杞稳定的内参基因。
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关 键 词: | 枸杞 内参基因 实时荧光定量PCR 定量分析 |
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