| 南阳黑猪肌内脂质沉积相关lncRNA鉴定和功能预测 |
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| 引用本文： | 刘京鸽,吴结革,徐世永,陈清,马凡华,张金璧.南阳黑猪肌内脂质沉积相关lncRNA鉴定和功能预测[J].江苏农业科学,2023(12):149-157. |
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| 作者姓名： | 刘京鸽 吴结革 徐世永 陈清 马凡华 张金璧 |
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| 作者单位： | 金陵科技学院动物科学与食品工程学院 |
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| 摘 要： | 为了探讨长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)在南阳黑猪肌内脂肪沉积中的重要作用，通过分析已发表的南阳黑猪高脂组和低脂组背最长肌转录组数据，通过编码潜能预测获得可能的lncRNA,结合DESeq2软件筛选出在南阳黑猪高脂组和低脂组背最长肌差异表达基因和lncRNA,并通过GO和KEGG通路富集分析，找出与南阳黑猪肌内脂肪沉积相关的差异表达lncRNA。结果表明，通过编码潜能预测获得61个新的lncRNAs,新鉴定lncRNAs和已知lncRNAs与编码基因相比较表现出一些典型特征，如转录本长度较短、外显子数较少。差异表达分析发现，814个编码基因和98个lncRNA在低脂和高脂组背最长肌间差异表达。差异表达的基因参与了多种与脂质代谢相关的信号通路，如甘油三脂代谢、PPAR信号通路、脂肪酸生物合成、脂肪酸降解等。联合差异表达lncRNAs的靶基因预测和差异表达基因结果分析表明，一些lncRNA可能作用于潜在的靶基因，参与脂质代谢过程，调控背最长肌脂质沉积。研究结果为进一步深入研究与猪脂质沉积相关的lncRNA生物学功能及调控机制奠定了基础，在未来育种中改...
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| 关 键 词： | 南阳黑猪 背最长肌 lncRNA 脂质代谢 |
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