| 意大利蜜蜂幼虫响应东方蜜蜂微孢子虫胁迫的高表达基因分析 |
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| 引用本文： | 黄枳腱,陈华枝,郭意龙,周丁丁,万洁琦,熊翠玲,郑燕珍,付中民,徐国钧,郭睿,陈大福.意大利蜜蜂幼虫响应东方蜜蜂微孢子虫胁迫的高表达基因分析[J].上海交通大学学报(农业科学版),2019(3):87-94. |
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| 作者姓名： | 黄枳腱 陈华枝 郭意龙 周丁丁 万洁琦 熊翠玲 郑燕珍 付中民 徐国钧 郭睿 陈大福 |
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| 作者单位： | 福建农林大学蜂学学院 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-44-KXJ7);福建省自然科学基金项目(2018J05042);福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158);福建农林大学科技创新专项基金项目(CXZX2017343);福建省大学生创新创业项目(201810389029,2) |
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| 摘 要： | 为探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)幼虫响应东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)胁迫的高表达基因(HEG)的作用,利用RNA-seq技术对正常的意蜂4、5和6日龄幼虫(Am4CK、Am5CK和Am6CK)及N.ceranae胁迫的意蜂4、5和6日龄幼虫(Am4T、Am5T和Am6T)进行测序。共得到268 765 544条原始读段,经过滤得到的有效读段数为266 318 442条,各样品的Q30均在92.42%及以上。根据FPKM值≥15的标准从上述6个样品中分别筛选出2 460、2 692、2 908、2 367、2 549和2 270个HEG。Venn分析结果显示,去除与对照组共有的HEG,Am4T、Am5T和Am6T的共有HEG数为3个,特有HEG数分别为373、210和79个。GO分类结果显示,Am4T、Am5T和Am6T的特有HEG分别能够注释26、27和16个GO条目,注释基因数最多的分别是代谢进程、结合和结合。KEGG分析结果显示这些特有HEG可分别富集在145、138和68条代谢通路,富集基因数最多的分别是过氧化物酶体、碳代谢和内质网蛋白加工。进一步分析结果表明N.ceranae胁迫可导致宿主的部分物质代谢、能量代谢和免疫代谢通路水平提高。从6个样品的共有HEG中随机选取10个进行RT-PCR验证,均能成功扩增出目的条带,说明本研究中的HEG真实存在。研究结果揭示了意蜂幼虫响应N.ceranae胁迫的HEG表达谱及作用,为深入解析宿主的胁迫应答机制提供了重要信息。
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| 关 键 词： | 意大利蜜蜂 幼虫 东方蜜蜂微孢子虫 转录组 高表达基因 胁迫应答 |
| 收稿时间： | 2018/11/24 0:00:00 |
Analysis of highly expressed genes in Apis mellifera ligustica larvae in response to Nosema ceranae stress |
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| HUANG Zhi-jian,CHEN Hua-zhi,GUO Yi-long,ZHOU Ding-ding,WAN Jie-qi,XIONG Cui-ling,ZHENG Yan-zhen,FU Zhong-min,XU Guo-jun,GUO Rui and CHEN Da-fu.Analysis of highly expressed genes in Apis mellifera ligustica larvae in response to Nosema ceranae stress[J].Journal of Shanghai Jiaotong University (Agricultural Science),2019(3):87-94. |
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| Authors: | HUANG Zhi-jian CHEN Hua-zhi GUO Yi-long ZHOU Ding-ding WAN Jie-qi XIONG Cui-ling ZHENG Yan-zhen FU Zhong-min XU Guo-jun GUO Rui and CHEN Da-fu |
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| Institution: | College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China,College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China and College of Bee Science,Fujian Agriculture and Forestry University,Fuzhou 350002,China |
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