| 四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析 |
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| 引用本文： | 王玲,左示敏,张亚芳,陈宗祥,潘学彪,黄世文.四川省稻瘟病菌群体遗传结构分析[J].中国水稻科学,2015,29(3):327-334. |
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| 作者姓名： | 王玲 左示敏 张亚芳 陈宗祥 潘学彪 黄世文 |
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| 作者单位： | 扬州大学江苏省作物遗传生理重点实验室/教育部植物功能基因组学重点实验室;中国水稻研究所 |
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| 基金项目： | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2012RG003-4) |
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| 摘 要： | 由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)侵染引起的稻瘟病是全球水稻生产上最严重的病害之一。利用6对SSR荧光标记对采自四川绵阳、营山、雅安、北川和武胜地区的5个稻瘟病菌群体的遗传结构进行分析。结果表明,在124个稻瘟病菌中检测出43个等位基因,平均每个位点的观测等位基因数为7.2,有效等位基因数为3.1,所有位点均显著偏离HardyWeinberg平衡。5个群体的平均观测杂合度(0.374)低于期望杂合度(0.502),暗示群体内存在因近交而导致的杂合子缺失。AMOVA分析显示,绝大多数遗传变异(81.17%)存在于群体内个体间,仅有18.83%的变异来自于群体间的差异。5个地理群体间呈现高水平的遗传分化(遗传分化系数为0.057~0.528)。Mantel检验表明,群体间的遗传距离与地理距离相关未达显著水平,说明稻瘟病菌的遗传变异呈现随机分布的空间模式。群体遗传学数据分析表明5个群体间存在不同程度的基因流(基因流水平为0.472~4.347),基于贝叶斯聚类法的Structure分析也证实了这一结果。
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| 关 键 词： | 稻瘟病 稻瘟病菌 遗传多样性 遗传结构 SSR标记 |
| 收稿时间： | 2014-07-31 |
Genetic Structure of Rice Blast Pathogen Magnaporthe oryzae in Sichuan Province |
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| WANG Ling;ZUO Shi-min;ZHANG Ya-fang;CHEN Zong-xiang;PAN Xue-biao;HUANG Shi-wen.Genetic Structure of Rice Blast Pathogen Magnaporthe oryzae in Sichuan Province[J].Chinese Journal of Rice Science,2015,29(3):327-334. |
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| Authors: | WANG Ling;ZUO Shi-min;ZHANG Ya-fang;CHEN Zong-xiang;PAN Xue-biao;HUANG Shi-wen |
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| Institution: | WANG Ling;ZUO Shi-min;ZHANG Ya-fang;CHEN Zong-xiang;PAN Xue-biao;HUANG Shi-wen;Key Laboratory of Crop Genetics and Physiology of Jiangsu Province/Key Laboratory of Plant Functional Genomics of Ministry of Education,Yangzhou University;China National Rice Research Institute; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rice blast disease Magnaporthe oryzae genetic diversity genetic structure SSR marker |
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