基于BSA-seq技术的马铃薯块茎蛋白含量基因定位与分子标记开发 |
| |
引用本文: | 史可昕,石瑛,张朝澍.基于BSA-seq技术的马铃薯块茎蛋白含量基因定位与分子标记开发[J].西南农业学报,2023(3):505-514. |
| |
作者姓名: | 史可昕 石瑛 张朝澍 |
| |
作者单位: | 1. 东北农业大学农学院;2. 寒地粮食作物品种改良与生理生态教育部重点实验室 |
| |
基金项目: | 黑龙江省自然科学基金联合引导项目(LH2021C027); |
| |
摘 要: | 【目的】开发与四倍体马铃薯蛋白含量相关的分子标记,加快选育高蛋白的马铃薯品种,提高马铃薯品种竞争力。【方法】以高蛋白马铃薯品种‘大西洋’为母本、低蛋白品种‘定薯1号’为父本构建分离群体,利用混池和高通量简化基因组测序技术相结合的方法(BSA-seq)对马铃薯块茎蛋白含量进行QTL定位,在定位区间开发与马铃薯块茎蛋白含量紧密连锁的SSR标记,并使用分离群体及四倍体马铃薯品种进行筛选验证。【结果】在2号、4号染色体共定位到3个控制马铃薯块茎蛋白含量的主效位点,分别位于2号染色体18.88~21.59 Mb,区间大小为2.71 Mb; 4号染色体8.3~12.84 Mb,区间大小为4.54 Mb; 4号染色体65.12~66.39 Mb,区间大小为1.27 Mb。根据定位区域、基因位置及参考基因组信息,使用NR、 Tr EMBL、 KEGG、 GO、 KOG、 swissprot、 PFAM共7个功能数据库对候选基因进行功能注释,共注释到719个候选基因,注释基因显著富集在玉米素合成代谢通路,该代谢通路可阻止蛋白质降解。在2号染色体18.88~21.59 Mb区间内开发分子标记pChr2-4...
|
关 键 词: | 马铃薯蛋白含量 BSA-seq SSR标记 分子标记辅助选择 |
|