| 花生KNOX基因家族的全基因组鉴定及组织表达分析 |
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| 引用本文： | 宋晓峰,鲁成凯,董晓娜,高晓东,孙熙文,付春.花生KNOX基因家族的全基因组鉴定及组织表达分析[J].山东农业科学,2023(8):1-10. |
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| 作者姓名： | 宋晓峰 鲁成凯 董晓娜 高晓东 孙熙文 付春 |
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| 作者单位： | 潍坊市农业科学院 |
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| 基金项目： | 潍坊市科技发展计划项目(2022ZJ1087)；;财政部和农业农村部：国家现代农业产业技术体系项目(CARS-13)； |
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| 摘 要： | 为研究花生KNOX基因家族在生长发育以及非生物胁迫响应中的功能，本研究采用生物信息学手段在栽培种花生基因组水平上对KNOX基因家族成员进行鉴定，并对其理化性质、基因结构、蛋白质保守结构域、系统进化、启动子顺式作用元件以及组织与逆境下的表达模式进行分析。结果显示：花生基因组中共有26个KNOX基因家族成员，分布在17条染色体上，绝大多数编码酸性蛋白，均为亲水性蛋白，并全部定位于细胞核。系统发育分析可将花生KNOX家族分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族，并进一步分为4个亚组。启动子分析发现一些与生长发育、激素和胁迫响应相关的顺式作用调控元件。全生育期组织表达分析结果显示，ClassⅠ类基因表达组织特异性明显，主要在花、营养茎尖、生殖茎尖、果针等组织中高表达；ClassⅡ类基因时空表达更广泛。在7种非生物胁迫处理下，部分基因表达量变化较大，其中5个基因响应特定胁迫，RT-qPCR验证了2个特异性响应PEG胁迫的基因。本研究为进一步探究花生KNOX基因在生长发育、逆境响应中的功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 花生 KNOX基因家族 全基因组鉴定 生物信息学分析 表达分析 |
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