| 辣椒PP2C家族基因鉴定与响应低温胁迫的表达分析 |
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| 引用本文： | 马玉虎,魏敏,段盼盼,刘芳,匡小研,魏兵强.辣椒PP2C家族基因鉴定与响应低温胁迫的表达分析[J].干旱地区农业研究,2023(6):39-53. |
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| 作者姓名： | 马玉虎 魏敏 段盼盼 刘芳 匡小研 魏兵强 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学园艺学院，甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 甘肃省重点研发项目（21YF5NA091）；兰州市人才创新创业项目（2021-RC-65）；甘肃农业大学青年导师扶持基金（GAU-QDFC-2020-07） |
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| 摘 要： | 对辣椒PP2C基因家族成员进行全基因组鉴定和特征分析，并研究CaPP2Cs基因在低温胁迫下的表达模式，结果表明：在辣椒参考基因组共系统鉴定出99个CaPP2Cs基因家族成员，并不均匀地分布在12条染色体上，CaPP2Cs基因编码的氨基酸数介于99~1 572 aa，分子量介于10.94~178.40 Da，等电点介于4.08~9.51。系统进化树分析可将辣椒和拟南芥的PP2C基因分为13个亚族，每个亚族均含有辣椒PP2C基因，基因结构分析表明CaPP2Cs基因的外显子数量介于1~18；在CaPP2Cs基因的启动子中发现许多与光、低温和激素响应有关的顺式作用元件。转录组数据分析表明，CaPP2C31基因在叶片中的表达量显著高于其他基因，CaPP2C16则特异性地表达于授粉后50 d的胎座中。低温处理24 h时，CaPP2C97和CaPP2C3在叶片中呈现显著的下调表达；低温处理1 h时，CaPP2C36、CaPP2C5、CaPP2C53、CaPP2C43、CaPP2C99等基因在根中明显上调，CaPP2C19、CaPP2C23、CaPP2C44、CaPP2C95则显著下调，表明CaPP2Cs可能在辣椒响应低温胁迫中发挥作用。
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| 关 键 词： | 辣椒 生物信息学 表达模式 低温胁迫 PP2C基因 |
Identification and expression analysis of PP2C family genes in pepper in response to low temperature stress |
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| MA Yuhu,WEI Min,DUAN Panpan,LIU Fang,KUANG Xiaoyan,WEI Bingqiang.Identification and expression analysis of PP2C family genes in pepper in response to low temperature stress[J].Agricultural Research in the Arid Areas,2023(6):39-53. |
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| Authors: | MA Yuhu WEI Min DUAN Panpan LIU Fang KUANG Xiaoyan WEI Bingqiang |
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| Institution: | College of Horticulture, Gansu Agricultural University, Lanzhou, Gansu 730070, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pepper bioinformatics expression pattern low temperature stress PP2C gene |
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