白菜TLP基因家族鉴定及表达分析 |
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引用本文: | 王紫雯,陈雨,吴晓宇,赵玉梅,任鑫如,吕金枝,李嘉利,段巧红,黄家保.白菜TLP基因家族鉴定及表达分析[J].山东农业科学,2023(1):22-31. |
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作者姓名: | 王紫雯 陈雨 吴晓宇 赵玉梅 任鑫如 吕金枝 李嘉利 段巧红 黄家保 |
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作者单位: | 山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室 |
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基金项目: | 山东省自然科学基金重点项目“大白菜乙烯合成关键酶基因BrACS6调控自交不亲和的分子机理研究”(ZR2020KC017); |
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摘 要: | 已有研究表明TLP(Tubby-like protein)蛋白在植物应对非生物胁迫方面具有重要作用。本研究利用生物信息学方法在白菜中鉴定得到14个TLP家族基因,并对其理化性质、基因结构特征、蛋白保守性、系统进化关系、组织表达模式及对盐胁迫的响应情况进行了初步分析。结果表明,该家族基因分布在白菜10条染色体中的7条。蛋白分子量介于38 735.69~52 747.34 D,等电点介于9.16~9.88。基因结构分析表明,有1个TLP基因含有9个CDS,绝大多数基因CDS为4~5个。亚细胞定位预测结果表明,该基因家族成员主要定位在细胞核、线粒体和细胞质基质。启动子顺式作用元件分析表明,该基因家族成员含有包括光响应元件、脱落酸应答元件、厌氧反应应答元件在内的大量逆境胁迫应答元件。组织特异性表达分析发现大多数BrTLPs在花中表达量较高,在茎、叶片和果荚中的表达量与根相似;绝大多数白菜TLP基因对盐胁迫都有不同程度的响应,其中BrTLP14对盐胁迫反应最强烈,暗示该基因可能在白菜响应盐胁迫过程中发挥重要作用。
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关 键 词: | 白菜 TLP基因家族 表达分析 |
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