| 整合宏基因组学分析生猪养殖粪污发酵过程中耐药基因的动态变化 |
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| 引用本文： | 赵素君,曹冶,李江凌,张金灵,刘锐,王秋实,于吉锋.整合宏基因组学分析生猪养殖粪污发酵过程中耐药基因的动态变化[J].西南农业学报,2023(3):655-664. |
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| 作者姓名： | 赵素君 曹冶 李江凌 张金灵 刘锐 王秋实 于吉锋 |
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| 作者单位： | 1. 四川省畜牧科学研究院;2. 动物遗传育种四川省重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家现代农业产业技术体系四川生猪创新团队粪污有害物迁移途径与环境影响研究岗位(sccxtd-2022-08)； |
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| 摘 要： | 【目的】探究生猪养殖粪污在堆肥过程中耐药基因的消减规律。【方法】以猪粪和菌渣为发酵原料，进行有氧堆肥处理，在堆肥第1、4、8、12、16、22、29天，进行上、中、下分层多点采样，提取总DNA构建文库，经定量和检测合格后，进行宏基因组测序分析。通过宏基因组学方法对堆肥过程中耐药基因的动态变化进行分析。【结果】堆肥期间共发现613个耐药基因，分别对32类抗生素产生耐药。其中，丰度较高的抗生素分别为青霉烷类抗生素(Penam)、头孢菌素类抗生素(Cephalosporin)、氨基糖苷类抗生素(Aminoglycoside antibiotic)、磷霉素类抗生素(Fosfomycin)、糖肽类抗生素(Glycopeptide antibiotic)和四环素类抗生素(Tetracycline antibiotic),这与现实中常用的抗生素种类相吻合。分析发现耐药基因的消减出现2个峰值，第一个峰值出现在试验起始时，在第4天迅速下降，然后在第12天(对照组)和第8天(实验组)达到第二个峰值，随着细菌的自然凋亡，耐药基因的丰度又下降到低值，慢慢消减下去。【结论】在堆肥过程中，生猪养殖粪污中耐药基因丰...
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| 关 键 词： | 宏基因组学 粪污 发酵 耐药基因 |
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