| 一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌基因分型及rpoE基因生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 周赛赛,李天娇,武琦,朱家平,罗宗,吕然,赵晓慧,王一飞,罗润波,贡嘎,王保宁,索朗斯珠.一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌基因分型及rpoE基因生物信息学分析[J].中国农业大学学报,2021,26(5):47-60. |
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| 作者姓名： | 周赛赛 李天娇 武琦 朱家平 罗宗 吕然 赵晓慧 王一飞 罗润波 贡嘎 王保宁 索朗斯珠 |
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| 作者单位： | 西藏农牧学院 动物科学学院, 西藏 林芝 860000;西藏农牧学院 动物科学学院, 西藏 林芝 860000; 四川大学 华西基础医学与法医学院, 成都 610041 |
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| 基金项目： | 国家肉牛牦牛产业体系项目(CARS-37)；西藏自治区科技厅2019年度重点项目 |
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| 摘 要： | 为分析本实验室分离保存的一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌基因型和rpoE基因编码蛋白的生物特性,通过16SrDNA、特异性基因、荚膜分型、脂多糖分型、rpoE基因扩增等分子生物学和生物信息学方法对此株牦牛源多杀性巴氏杆菌进行分析。结果表明:此株牦牛源多杀性巴氏杆菌为B∶L2∶ST44基因型,rpoE基因和印度牛源多杀性巴氏杆菌rpoE基因相似性为100%,分子量22.0ku,理论等电点4.86,属于不稳定、无跨膜结构、无信号肽、有保守结构域和有潜在磷酸化的胞内亲水性蛋白,二级结构α-螺旋占比最高67.02%,三级结构为棒状微弯曲模型,存在多个抗原表位,预测可与10个蛋白存在相互作用。综上,本研究对一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌进行基因分型和rpoE基因进行生物信息分析,为进一步了解西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌基因型和探索RpoE蛋白的生物学特性提供数据参考。
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| 关 键 词： | 牦牛 多杀性巴氏杆菌 基因分型 rpoE基因 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2020/8/10 0:00:00 |
Genotyping and rpoE gene bioinformatics analysis of a Pasteurella multocida strain in Tibetan yaks |
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| ZHOU Saisai,LI Tianjiao,WU Qi,ZHU Jiaping,LUO Zong,LV Ran,ZHAO Xiaohui,WANG Yifei,LUO Runbo,GONG G,WANG Baoning,Suolangsizhu.Genotyping and rpoE gene bioinformatics analysis of a Pasteurella multocida strain in Tibetan yaks[J].Journal of China Agricultural University,2021,26(5):47-60. |
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| Authors: | ZHOU Saisai LI Tianjiao WU Qi ZHU Jiaping LUO Zong LV Ran ZHAO Xiaohui WANG Yifei LUO Runbo GONG G WANG Baoning Suolangsizhu |
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| Institution: | Department of Animal Science, Tibet Agricultural and Animal Husbandry College, Linzhi 860000, China;Department of Animal Science, Tibet Agricultural and Animal Husbandry College, Linzhi 860000, China; Department of Pathogenic Biology, West China School of Basic Medical Science and Forensic Medicine, Sichuan University, Chengdu 610041, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | yak Pasteurella multocida genotyping rpoE gene bioinformatics analysis |
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