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大口黑鲈MyoD基因结构和单核苷酸多态性位点的筛选
引用本文:于凌云,白俊杰,叶星,李胜杰,李小慧.大口黑鲈MyoD基因结构和单核苷酸多态性位点的筛选[J].水产学报,2009,33(1):1-8.
作者姓名:于凌云  白俊杰  叶星  李胜杰  李小慧
作者单位:1. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306
2. 中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学院热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380
基金项目:国家科技支撑项目(NO.2005DKA21103)和国家科技基础条件平台工作项目(2005DKA21103)及广东省自然科学基金项目(NO.7301732)
摘    要:本研究采用PCR技术和基因组步移技术从大口黑鲈基因组DNA中扩增得到MyoD基因及其5’调控区序列。该基因序列全长3797bp,其中5’调控区长1077bp,MyoD基因转录区由3个外显子(分别为591bp、81bp和78bp)和2个内含子(分别为1077bp和486bp)组成。5’调控区含有与肌肉特异性基因转录密切相关的转录调控元件E box、肌细胞增强因子2(MEF2)、肌肉特异性金属硫蛋白结合位点(MTBF)及一些转录反应调控元件(TATA box 、OCAAT box、OCT1、PRE、AP4、Pit1)。运用PCR-SSCP技术和直接测序法进行大口黑鲈MyoD基因SNP位点筛选,结果表明MyoD基因序列中存在7个突变点,均位于内含子上。养殖群体中这7个突变点分析结果显示突变比例范围在0.042~0.353之间。本研究结果为SNPs位点与大口黑鲈生长性能关联分析奠定了基础。

关 键 词:大口黑鲈  筛选
收稿时间:2008/1/12 0:00:00
修稿时间:2/8/2008 12:00:00 AM

Molecular cloning and identification of single nucleotide polymorphisms of MyoD in largemouth bass(Micropterus salmoides
YU Ling-yun,BAI Jun-jie,YE Xing,LI Sheng-jie,LI Xiao-hui.Molecular cloning and identification of single nucleotide polymorphisms of MyoD in largemouth bass(Micropterus salmoides[J].Journal of Fisheries of China,2009,33(1):1-8.
Authors:YU Ling-yun  BAI Jun-jie  YE Xing  LI Sheng-jie  LI Xiao-hui
Institution:(1. pearl River Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences;
Abstract:
Keywords:MyoD  SNPs
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