| 猪CAⅢ基因CDS区克隆、生物信息学及组织表达分析 |
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| 引用本文： | 乐宝玉,张宁芳,成志敏,秦本源,吴怡琦,王媛媛,王鹤洁,蔡春波,高鹏飞,郭晓红,李步高,曹果清.猪CAⅢ基因CDS区克隆、生物信息学及组织表达分析[J].山西农业科学,2019(6). |
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| 作者姓名： | 乐宝玉 张宁芳 成志敏 秦本源 吴怡琦 王媛媛 王鹤洁 蔡春波 高鹏飞 郭晓红 李步高 曹果清 |
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| 作者单位： | 山西农业大学动物科技学院 |
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| 摘 要： | 对猪碳酸酐酶Ⅲ(Carbonic anhydraseⅢ,CAⅢ)基因进行克隆及生物信息学分析,并分析该基因的时空表达特性。通过RT-PCR和克隆测序技术获得猪CAⅢ基因的CDS序列,综合利用多种生物信息学软件,对该基因编码的蛋白质生物学特性进行预测,采用qRT-PCR技术检测CAⅢ基因的组织表达谱和时序表达规律。结果表明,猪CAⅢ基因CDS区长783 bp,编码260个氨基酸;CAⅢ蛋白为亲水性碱性蛋白,无信号肽,主要在细胞质中发挥作用;CAⅢ基因在心脏、肝脏、胰脏、肺、胃、背最长肌、皮下脂肪、脾脏、盲肠等9种组织中均有表达,但在背最长肌中表达量最高,极显著地高于其他组织。从初生到5月龄,大白猪背最长肌中CAⅢ基因 mRNA表达量呈上升—下降—上升—下降的趋势,初生时最低,随后表达量逐渐升高,到3月龄时达到峰值,之后开始下降;马身猪中,从初生到5月龄,CAⅢ基因 mRNA的表达量基本呈上升趋势,在5月龄时达到峰值,极显著地高于其他各个阶段。2个不同品种相比,3月龄和4月龄时,大白猪CAⅢ mRNA表达量显著或极显著地高于马身猪;而在5月龄时,马身猪CAⅢ mRNA表达量极显著地高于大白猪,其他阶段2个品种CAⅢ mRNA表达量无显著差异。CAⅢ基因可能直接或间接参与猪骨骼肌的生长发育过程。
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| 关 键 词： | 猪 CAⅢ基因 生物信息学分析 时空表达特性 |
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