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东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析
引用本文:张 涵,解长占,李太元,哈 卓,李卓昕,李成辉,李金凤,赵冠宇,郭影成,鲁会军,金宁一.东北地区3株猪细小病毒7型毒株基因组测定及遗传进化分析[J].中国动物检疫,2018,35(11):71-74.
作者姓名:张 涵  解长占  李太元  哈 卓  李卓昕  李成辉  李金凤  赵冠宇  郭影成  鲁会军  金宁一
基金项目:国家重点研发计划项目(2016YFD0500401,2018YFD0500104)
摘    要:从东北地区采集的150份猪肺脏样品中,检测出3株猪细小病毒毒株。根据PPV7标准株NCBI登录号KU563733设计3对引物,对3个病毒株的基因片段进行扩增测序,将测序结果依次进行拼接,获得3个病毒株的NS1和CP基因序列,然后进行序列的同源性比对及进化树分析。结果显示:3个毒株的NS1基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为94.4%~95.2%、94.1%~95.1%和93.5%~94.3%;CP基因序列与经典PPV7毒株的同源性分别为89.6%~91.8%、89.8%~92.0%和89.6%~91.7%。通过进化树比对分析,确认3株PPV毒株为PPV7亚型。通过对其他病毒进行检测,发现PPV7与PCV2、PPV2的混合感染率较高。该分析结果为我国东北地区猪病防控提供了依据。

关 键 词:猪细小病毒7型(PPV7)  基因组测定  遗传进化分析

Gene Sequencing and Genetic Evolution Analysis of Three PPV7 Strains in Northeast China
Zhang Han,Xie Changzhan,Li Taiyuan,Ha Zhuo,Li Zhuoxin,Li Chenghui,Li Jinfeng,Zhao Guanyu,Guo Yingcheng,Lu Huijun,Jin Ningyi.Gene Sequencing and Genetic Evolution Analysis of Three PPV7 Strains in Northeast China[J].China Journal Of Animal Quarantine,2018,35(11):71-74.
Authors:Zhang Han  Xie Changzhan  Li Taiyuan  Ha Zhuo  Li Zhuoxin  Li Chenghui  Li Jinfeng  Zhao Guanyu  Guo Yingcheng  Lu Huijun  Jin Ningyi
Abstract:
Keywords:
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