| 大豆BBX基因家族的鉴定及表达 |
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| 引用本文： | 殷丽丽,邢宝龙,陈晓亮,等.大豆BBX基因家族的鉴定及表达[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2022,50(6):35-45. |
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| 作者姓名： | 殷丽丽 邢宝龙 陈晓亮 等 |
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| 作者单位： | 山西大同大学 生命科学学院;山西农业大学 高寒区作物研究所;山西大同大学 医学院 |
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| 基金项目： | 山西省重点研发项目（201803D221020-1）；山西省应用基础研究计划（青年科技研究基金）项目（201901D211427）；山西省高校科技创新项目（2020L0494,2020L0496）；山西省农科院育种工程项目（17yzgc069-1） |
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| 摘 要： | 【目的】对大豆（Glycine max）全基因组BBX（B-box）蛋白基因进行鉴定和生物信息学分析，探究其对非生物逆境胁迫的响应模式，为大豆BBX基因的应用提供参考。【方法】利用生物信息学方法鉴定大豆BBX基因家族成员，分析其保守结构域、系统进化树、基因复制关系、顺式作用元件、组织特异性表达和非生物逆境胁迫（干旱和100 mmol/L NaCl胁迫，均处理0，1，6，12 h）响应模式。【结果】大豆BBX基因家族（GmBBXs）有42个成员，分布在除2和16号染色体外的18条染色体上。保守结构域分析表明，GmBBXs在N端有一个或两个B-box结构域（B-box1和B-box2），B-box1较B-box2保守；部分成员在C端存在一个CCT结构域。系统发育分析表明，GmBBXs家族成员分为5个亚家族，分别为B1+B2+CCT（Ⅰ型和Ⅱ型）、B1+CCT（Ⅲ型）、B1+B2（Ⅳ型）和B1（Ⅴ型）类型，其成员数量分别为3，8，6，18和7。共线性分析发现，在GmBBXs基因的扩展中存在串联复制和片段复制事件，且片段复制事件比例较串联复制大。GmBBXs基因启动子上含有多种顺式作用元件，如光应答元件、逆境胁迫应答元件和激素响应元件等。GmBBXs基因表达分析结果显示，GmBBXs在大豆根、茎、叶、花、荚果和种子中的表达存在差异，不同GmBBXs响应干旱和盐胁迫的方式不同，获得的36个GmBBXs基因表达数据可分为6种表达模式。【结论】在大豆中共鉴定得到42个GmBBXs基因，分布于18条染色体上，其结构域较为保守;GmBBXs的表达具有组织特异性，参与干旱和盐胁迫响应。
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| 关 键 词： | 大豆育种 BBX基因家族 基因表达 非生物逆境胁迫 |
| 收稿时间： | 2021/6/23 0:00:00 |
Genome wide identification and expression patterns of BBX gene family members in Glycine max |
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| YIN Lili,XING Baolong,CHEN Xiaoliang,et al.Genome wide identification and expression patterns of BBX gene family members in Glycine max[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2022,50(6):35-45. |
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| Authors: | YIN Lili XING Baolong CHEN Xiaoliang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Glycine max breeding BBX gene family gene expression abiotic stress |
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