| 相思杂种优势的转录组初步分析 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院热带林业研究所,广州,510520 |
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| 摘 要： | 马大杂种相思(Acacia mangium×A. auriculiformis)是生产中极具潜力的相思新树种,为了探索相思杂种优势的分子机理,本研究通过高通量转录组测序技术对大叶相思、马占相思及其子代马大杂种相思的幼嫩叶片进行无参转录组测序分析。结果显示大叶相思、马大杂种相思和马占相思质控数据的Clean reads分别为42 595 190、55 373 032和46 553 286条,有效数据占原始Raw reads的比例在99%以上;Q20、Q30分别高于98%和95%。优化组装后总转录本数量为133 473,总Unigenes为83 117,序列碱基总数为122 735 856 bp,其中1 000 bp以内的共有63 377条,占总数的76%以上。3种相思的Unigenes表达量分布十分接近,共同检测到的Unigenes为20 379个,对这些Unigenes进行KEGG功能注释,共注释到129个不同的通路中,其中光合作用、植物激素信号转导通路中的相关基因显著富集。对3种相思注释到map00195 (光合通路)中的Unigenes进行表达量的差异分析,发现大部分的Unigenes在马大杂种相思中的表达量均高于双亲。这些Unigenes对应的基因主要为影响光合作用过程的关键基因,且马大杂种相思的光合通路中的相关基因表达量均显著高于双亲,由此推测这是导致杂种相思生长优势的主要原因。本研究结果可为今后开展相思杂交育种提供理论依据。
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| 关 键 词： | 相思 杂种优势 转录组测序 基因 光合作用 |
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