| 外源因子处理下蓝莓不同发育阶段果实的转录组分析 |
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| 引用本文： | 彭舒,袁玮,张婷渟,杨芩.外源因子处理下蓝莓不同发育阶段果实的转录组分析[J].分子植物育种,2021(3). |
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| 作者姓名： | 彭舒 袁玮 张婷渟 杨芩 |
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| 作者单位： | 凯里学院大健康学院 |
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| 基金项目： | 贵州省科学技术基金计划项目(黔科合基础[2016]1132)资助。 |
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| 摘 要： | 采用Illumina测序技术对在醋酸钙、硫酸铵和蔗糖处理后蓝莓不同发育阶段的果实进行转录组测序,获得Clean Reads 2723731442条,经组装得到平均长度为753.65 nt的87608条Unigene。将转录组Unigene进行基因功能注释,其中39867条Unigene能被NR数据库注释,与葡萄同源序列最多,占8.58%;与GO数据库比对发现,有29661条Unigene获得注释,分别匹配到生物过程、细胞组成和分子功能三大类共59个分支;与KOG数据库进行比对,发现有21992条Unigene具有功能信息,分别涉及25类;根据KEGG数据库的注释信息进行Pathway注释,参与的代谢通路共有246条;共检测到8704个SSR位点,其中双碱基重复的SSR占78.57%。本研究为探索外源物质调控蓝莓果实生长发育、生理代谢的分子机理提供了理论基础。
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| 关 键 词： | 外源因子 蓝莓果实 不同发育阶段 转录组 基因功能注释 |
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