转录组与蛋白组技术结合分析水稻耐低温分子机制 |
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作者单位: | 广东省农业科学院水稻研究所,广东省水稻育种新技术重点实验室,广州,510640;香港中文大学生命科学学院,农业生物技术国家重点实验室大豆研究中心,香港,999077 |
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基金项目: | 广东省科技计划;广东省农业科技创新及推广项目;广东省现代农业科技产业体系创新团队项目;广州市科技计划;实验室建设项目;广东省农业厅发展粮食生产项目 |
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摘 要: | 低温冷害是影响水稻生长发育最严重的非生物胁迫之一。鉴定水稻耐冷相关功能基因、解析其调控耐冷性的分子机制,对水稻耐冷性分子育种有重要意义。本研究以强耐冷的粳稻品种‘丽江新团黑谷’(LTH)和低温敏感的籼稻品种‘三黄占2号’(SHZ-2)为材料,通过全基因组转录和蛋白表达谱分析这两个品种对低温响应的差异,鉴定LTH和SHZ-2差异表达的基因和蛋白及其信号通路。研究显示,两个材料中差异表达基因主要富集在蛋白代谢途径、糖代谢途径和膜转运相关途径等生物学过程,并发现抗病相关防卫基因在抗病但不耐冷的SHZ-2中上调,而在耐冷但不抗病的LTH中没有显著上调,表明水稻抗病性与耐冷性存在内在关系。此外,还发现LTH和SHZ-2之间存在很多在转录水平和翻译水平表达差异不一致的基因。本研究从转录和翻译水平对耐冷和低温敏感两个水稻品种在低温胁迫下的响应进行分析,研究结果促进对水稻苗期耐冷性分子调控机制的全面认识,并为下一步水稻耐冷基因的鉴定和耐冷性分子机制的深入研究奠定基础。
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关 键 词: | 水稻 耐冷性 转录组 蛋白质组 |
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