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水稻抗稻瘟病基因Bsr-d1的SNP区域在地方品种中的变异分析
作者单位:云南农业大学植保学院,昆明,650201;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南省农业生物技术重点实验室,农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,昆明,650205;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南省农业生物技术重点实验室,农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,昆明,650205;云南农业大学植保学院,昆明,650201
摘    要:为揭示地方水稻品种中稻瘟病持久抗性基因Bsr-d1序列变异类型,本研究以收集到的缅甸、老挝和越南共79份地方水稻品种为供试材料,设计抗稻瘟病Bsr-d1基因特异引物对Bsr-d1基因启动子功能位点区段进行PCR扩增及测序分析。研究表明,79份地方水稻均持有抗稻瘟病Bsr-d1或bsr-d1等位基因,品种间存在18个变异位点和22个碱基的差异,根据差异所有品种可归为6种单倍型,其中H4和H6为优势单倍型,分别占测试品种的20.25%、58.23%;6种单倍型中仅H3单倍型携带抗性位点,有8个材料归为此类型,占10.13%。缅甸地方品种拥有H1 (15.79%)、H2 (2.63%)、H3 (13.16%)、H4 (18.42%)、H6 (50%)等5种单倍型,优势单倍型为H6;老挝地方品种有H1 (2.56%)、H3 (7.69%)、H4 (23.08%)、H5 (2.56%)、H6 (64.10%) 5种单倍型,H6为优势单倍型,表明缅甸、老挝间在单倍型种类和抗性品种比例上均存在一定差异。本研究结果表明缅甸、老挝水稻资源携带持久抗性基因Bsr-d1的品种比例远高于中国品种,对中国选育稻瘟病持久抗性品种具有重要的利用价值,应加强对该地区种质的引进和分析评价。

关 键 词:水稻  种质资源  稻瘟病  抗性基因  单倍型
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