| 基于转录组测序的黑枣EST-SSR引物开发与鉴定分析 |
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| 引用本文： | 庞丁玮,武素然,张军,李昕蔓,王军,陈怡妍,杨敏生.基于转录组测序的黑枣EST-SSR引物开发与鉴定分析[J].分子植物育种,2021,19(1):200-208. |
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| 作者姓名： | 庞丁玮 武素然 张军 李昕蔓 王军 陈怡妍 杨敏生 |
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| 作者单位： | 河北农业大学林学院,林木种质资源与森林保护重点实验室,保定,071000;河北雾灵山国家级自然保护区管理中心,兴隆,067399;河北省洪崖山国有林场,易县,074200;河北农业大学林学院,林木种质资源与森林保护重点实验室,保定,071000;河北雾灵山国家级自然保护区管理中心,兴隆,067399 |
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| 基金项目： | 河北农业大学科研发展基金计划项目(JY2018006);河北洪崖山‘冀洪1号’无核黑枣乡土树种品种审定项目(S-SV-DL-007-2017)共同资助。 |
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| 摘 要： | 目前黑枣已有的分子标记比较匮乏,本研究基于转录组测序技术对黑枣品种进行SSR引物开发,为黑枣种质资源评价及分子标记辅助育种提供有力的技术支持。本研究对‘冀洪1号’黑枣转录组序列进行了分析筛选和开发,并利用开发出的引物进行了验证分析。结果表明:共得到52 537个Unigene序列,SSR位点总数22 327个,包含SSR的Unigene序列数为15 286条。黑枣SSR位点的重复单元中,二核苷酸重复类型的SSR最多(52.26%),其次为单核苷酸(25.84%)及三核苷酸(19.25%)。随机挑选90对EST-SSR引物进行验证,有效扩增率为77.78%(70对),多态性引物比例为18.57%(13对),对13个多态性位点进一步分析可得,共扩增了35个等位基因,PIC值介于0.233~0.677之间,平均为0.430。本研究开发出的EST-SSR分子标记,为后期进行黑枣良种的鉴别及分子育种提供了分子技术手段。
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| 关 键 词： | 黑枣 转录组 EST-SSR 引物 |
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