| 六种新疆特色梨果的转录组分析 |
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| 引用本文： | 文豪,王文强,姜喜,白红进,吴翠云,沈立荣.六种新疆特色梨果的转录组分析[J].分子植物育种,2021,19(6):1847-1857. |
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| 作者姓名： | 文豪 王文强 姜喜 白红进 吴翠云 沈立荣 |
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| 作者单位： | 浙江大学生物系统工程与食品科学学院,杭州,310058;塔里木大学生命科学学院,阿拉尔,843300 |
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| 基金项目： | 兵团南疆重点产业支撑计划项目(2017DB006)资助。 |
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| 摘 要： | 梨是新疆地区栽培面积和产量较大、品种资源丰富的一类特色果树,具有重要的产业地位。为促进新疆特色梨从传统育种向现代育种方式发展,迫切需要开展功能基因的挖掘。本研究以轮台句句梨、南果梨、香梨、鸭梨、圆黄、红茄等6种新疆特色梨果为材料,进行了无参转录组学分析,获得1021868070条高质量Clean read数据,总碱基数为152530521446 bp。Clean read经De novo组装后获得78827条Unigene。采用六大公共数据库作同源比对,注释到50542个Unigene。对Unigene作GO和KEGG功能分类,获得49个功能群和130个通路,确定了绿原酸合成途径的部分候选基因,并检测到17416个SSR位点。本研究为新疆特色梨果功能成分绿原酸合成分子机理研究和遗传多样性分析提供了科学依据。
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| 关 键 词： | 新疆梨果 转录组分析 功能注释 |
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