| 猕猴桃抗溃疡病转录组分析和基因功能注释 |
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| 引用本文： | 井赵斌.猕猴桃抗溃疡病转录组分析和基因功能注释[J].分子植物育种,2021,19(6):1830-1838. |
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| 作者姓名： | 井赵斌 |
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| 作者单位： | 渭南职业技术学院农林科技学院,渭南,714026;渭南市果业研究院,渭南,714026;西北农林科技大学园艺学院,杨凌,712100 |
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| 基金项目： | 陕西省教育厅专项科学研究计划项目(18JK0982);渭南市科技计划项目(2018-ZDYF-NYCX-7);陕西省重点研发计划项目(2020NY-074)共同资助。 |
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| 摘 要： | 为了发掘中国野生猕猴桃资源抗溃疡病基因,利用Illumina HiSeq测序平台对不同时间接种溃疡病菌的毛花猕猴桃进行mRNA高通量测序。结果表明,共获得68731个Unigene,其中有48414个基因注释到Nr、SwissProt、KEGG和COG/KOG数据库。KOG注释显示,通用功能预测、转录后修饰、蛋白代谢、伴侣蛋白、信号转导机制,翻译、核糖体结构和生物合成所占比例最高;GO注释表明参与生物过程的差异表达基因数目最多,细胞组分和分子功能次之;KEGG通路分析表明差异基因的富集以生物合成和代谢为主。接种后不同时间点共获得63050个差异表达基因。通过SSR位点分析,从68731个Unigene中鉴定出13652个SSRs位点;同时获得了各类型转录因子1580个;R基因3727个。本研究结果对猕猴桃抗溃疡病基因发掘和抗溃疡病新品种选育具有重要的理论指导和育种实践意义。
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| 关 键 词： | 猕猴桃(Actinidia Lindl.) 溃疡病 转录组 差异表达基因 |
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