| 基于高通量测序的野百合转录组分析 |
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| 作者单位： | 陕西省西安植物园(陕西省植物研究所),西安,710061;陕西省科学技术情报研究院,西安,710061;陕西省西安植物园(陕西省植物研究所),西安,710061;陕西省植物资源保护与利用工程技术研究中心,西安,710061 |
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| 基金项目： | 陕西省重点研发计划项目;中医药公共卫生服务补助专项全国中药资源普查项目;陕西省中医药管理局科研专项 |
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| 摘 要： | 本研究基于新一代高通量测序技术平台Illumina Hi SeqTM4000对野百合进行转录组测序,对物种的转录组序列进行统计,并将得到的数据进行de novo组装,结果共获得47 605条Unigenes,总长度为33 972 306 bp,平均长度为713 bp,N50为1 204 bp。将获得的Unigenes与Nr、Swiss-Prot、KEGG以及KOG数据库进行比对,结果显示,分别有28 104、17 739、11 984及14 682条Unigenes成功注释。通过与KOG数据库进行比对,可分为25个不同的功能注释。与GO数据库进行比对,结果显示,共有33 254条Unigene获得注释,这些功能注释分为三大类50个功能亚类。其中,生物过程最多。以KEGG数据库参考,共有11 984条Unigenes参与133条代谢途径分支,以代谢相关的通路较为集中,找到了与花青素合成关键酶的Unigenes。本研究极大地丰富了野百合的基因资源,为进一步开展野百合功能基因及分子标记育种等方面的研究提供了一定理论支持与依据。
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| 关 键 词： | 野百合(Lilium brownie) Illumina高通量测序 转录组 |
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