洋葱黄矮病毒的实时荧光RT-PCR检测方法 |
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引用本文: | 刘建青,王韬远,李小宇,张春雨,苏颖,魏健,张金花,王永志.洋葱黄矮病毒的实时荧光RT-PCR检测方法[J].中国蔬菜,2022(3):72-77. |
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作者姓名: | 刘建青 王韬远 李小宇 张春雨 苏颖 魏健 张金花 王永志 |
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作者单位: | 1. 吉林省农业科学院;2. 长春师范大学生命科学学院;3. 芜湖职业技术学院 |
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基金项目: | 国家重点研发计划子课题(2017YFD0201604); |
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摘 要: | 洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)是危害葱属植物的主要病毒之一。本试验根据OYDV外壳蛋白(coat protein,CP)基因保守序列设计特异性引物,建立并优化了OYDV实时荧光RT-PCR检测方法,并对其特异性、敏感性和重复性进行了验证。结果显示:标准曲线Ct值与模板拷贝数的对数呈良好的线性关系,相关系数R~2为0.996,扩增效率为95.921%;与青葱X病毒(Shallot virus X,SVX)、葱潜隐病毒(Shallot latent virus,SLV)均无交叉反应;最低检出限为2.0 × 10~2 copies · μL-1,比常规RT-PCR大约高1 000倍;组内和组间变异系数均小于2%,具有良好的重复性。利用该方法对分别采集的各45份疑似OYDV感染的分蘖洋葱(珠葱)和大蒜样品进行检测,检出率较常规RT-PCR分别高40.00、6.67百分点,能更加客观地反映样品带毒情况。本试验建立的OYDV实时荧光RT-PCR方法具有良好的特异性、敏感性和重复性,可用于田间样品OYDV检测,为OYDV的有效防控提供...
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关 键 词: | 分蘖洋葱(珠葱) 大蒜 洋葱黄矮病毒 实时荧光RT-PCR |
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