| 泰山螭霖鱼线粒体16S rRNA基因片段序列及分子系统发育分析 |
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| 引用本文： | 杨玲,巩俊霞,李娴,张龙岗,付佩胜,张金路.泰山螭霖鱼线粒体16S rRNA基因片段序列及分子系统发育分析[J].长江大学学报,2016(33):37-42. |
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| 作者姓名： | 杨玲 巩俊霞 李娴 张龙岗 付佩胜 张金路 |
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| 作者单位： | 山东省淡水水产遗传育种重点实验室，农业部黄河下游渔业资源环境科学观测实验站，山东省淡水渔业研究院，山东 济南 250017 |
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| 基金项目： | 山东省农业良种工程项目，山东省现代农业产业体系鱼类创新团队项目(SDAIT-12-04)。 |
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| 摘 要： | 以泰山螭霖鱼(Varicorhinus macrolepis)30个个体为材料,对其线粒体16SrRNA基因片段进行了PCR扩增和序列对比,检测了泰山螭霖鱼的遗传多样性;结合从GenBank中下载的同源性较高的鲤科7属部分鱼类的同源序列,利用MGEA软件计算遗传距离,采用聚类分析方法,构建了NJ和UPGMA系统进化树。结果显示:30个体泰山螭霖鱼线粒体16SrRNA基因片段长度为468bp,无碱基的插入和缺失,共检测到1个多态位点,存在2种单倍型,其单倍型多样性(Hd)为0.067,核苷酸多样性(Pi)为0.00015,平均核苷酸差异数(K)0.067。遗传距离和NJ、UPGMA系统进化树表明,泰山螭霖鱼与多鳞白甲鱼的16SrRNA序列一致,泰山螭霖鱼所在的突吻鱼属与光唇鱼属的亲缘关系最近,与扁吻鱼属遗传距离最远。
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| 关 键 词： | 泰山螭霖鱼 (Varicorhinus macrolepis) 16S rRNA 遗传多样性 |
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