| 华重楼根茎内生细菌群落多样性及其功能预测 |
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| 引用本文： | 洪春桃,黄宗兴,张玲菊,魏斌,章建红.华重楼根茎内生细菌群落多样性及其功能预测[J].浙江农业科学,2020,61(11):2236-2240. |
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| 作者姓名： | 洪春桃 黄宗兴 张玲菊 魏斌 章建红 |
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| 作者单位： | 宁波市农业科学研究院,浙江 宁波 315040 |
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| 基金项目： | 宁波市科技富民项目(2017C10064) |
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| 摘 要： | 内生菌广泛存在于植物组织内部,是植物微生态系统的重要组成部分。为了解华重楼根茎内生细菌的群落组成和其潜在的生物学功能,采用高通量16S rRNA测序技术分析了2 年生华重楼根茎内生细菌群落多样性,并通过PICRUSt分析,评价了其内生细菌的潜在功能。结果表明,5个华重楼根茎共获得112 267条16S rRNA V3-V4区高质量序列片段,内生细菌群落的α-多样性Chao1指数、Observed species指数、PD whole tree指数和Shannon指数的平均值分别为3417.7、748.0、40.7和8.3;其优势门为厚壁菌门和放线菌门,优势变形菌纲为γ-变形菌纲和α-变形菌纲,优势菌属为Dubosiella(占比为5.61%)。16S rRNA功能预测结果显示,华重楼根茎内生细菌功能主要涉及膜运输、能量代谢、碳水化合物代谢、氨基酸代谢和辅酶因子、维生素代谢等。华重楼根茎内生细菌群落多样性丰富,具有大量代谢相关的有益菌。
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| 关 键 词： | 华重楼 根状茎 内生菌 16S rRNA测序技术 |
| 收稿时间： | 2020-08-29 |
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