| 灵芝全基因组SSR标记开发及其种质资源遗传多样性评估 |
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| 引用本文： | 何金宇,刘玉洋,徐靖,王晓彤,陈晓俊,王慧中,卢江杰.灵芝全基因组SSR标记开发及其种质资源遗传多样性评估[J].浙江农业科学,2020,61(5):967-973. |
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| 作者姓名： | 何金宇 刘玉洋 徐靖 王晓彤 陈晓俊 王慧中 卢江杰 |
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| 作者单位： | 1.杭州师范大学 生命与环境科学学院,浙江 杭州 310036; 2.浙江省药用植物种质改良与质量控制技术重点实验室,浙江 杭州 310036; 3.浙江省珍稀植物药工程技术研究中心,浙江 武义 321200; 4.浙江寿仙谷医药股份有限公司,浙江 武义 321200 |
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| 基金项目： | 浙江省农业(中药材)新品种选育重大科技专项(2016C02057) |
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| 摘 要： | 灵芝是我国传统“九大仙草”之一的名贵中药材,具有调节免疫、抗肿瘤、抗病毒、降血糖、抗氧化等药理活性。灵芝种类繁多,品质参差不齐,种质资源鉴定以及新品种培育是灵芝育种研究的重要内容之一。简单重复序列标记(SSR)技术可从DNA分子层面对灵芝种质资源进行鉴定和遗传多样性评估,有效避免了环境因素和人为因素的干扰,对推动灵芝产业良性发展具有重要意义。本研究通过分析灵芝全基因组信息,利用MISA软件扫描到4 038个SSR位点,共设计出1 442对引物,随机合成50对引物并用2个灵芝DNA进行验证,发现其中44对引物为真实SSR引物,占总数的88%。我们利用筛选出的44对SSR引物对11份灵芝种质资源进行遗传多样性评估,结果发现,11份灵芝材料间的遗传距离在0.120~0.962,其中GL-2号和GL-11号、GL-3号和GL-11号灵芝材料间遗传距离最大(0.962),GL-7号和GL-8号灵芝材料间遗传距离最小(0.120)。通过聚类分析对11份灵芝材料进行区分,其中野生的菌种及其后代(第3类)可以很好地与栽培菌种及其后代(第1类和第2类)区分,但是相同原始菌种LZ32来源的不同世代家系可划分为2大类,这可能是原始菌种LZ32不纯造成的结果。通过本研究证明灵芝全基因组SSR分子标记技术可用于种质资源鉴定和遗传多样性分析。
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| 关 键 词： | 灵芝 全基因组 SSR标记 种质资源 遗传多样性 |
| 收稿时间： | 2020-02-11 |
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