| 基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发 |
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| 引用本文： | 葛辰,凌去非,李彩娟,叶竹青,韩晓飞,王国成,朱鹏飞.基于第二代测序的大鳞副泥鳅生长相关SNP标记的开发[J].江苏农业科学,2014(10). |
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| 作者姓名： | 葛辰 凌去非 李彩娟 叶竹青 韩晓飞 王国成 朱鹏飞 |
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| 作者单位： | 苏州大学医学部基础医学与生物科学学院,江苏苏州,215123 |
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| 基金项目： | 江苏省农业科技自主创新资金，江苏省科技支撑计划，江苏省水产三项工程( |
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| 摘 要： | 大鳞副泥鳅是鳅科重要经济鱼类,通过Illumina HiSeq 2000测序平台对2个大鳞副泥鳅样本的转录本进行了高通量测序,其中AB2011M-1是群体中生长较快的10尾鱼的混合转录本,AB2011M-2是生长较慢的10尾鱼的混合转录本。通过对以上2个混合转录本的测序,分别获得了65 536和80 786个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)突变;对2个测序样本进行表达差异的比较,获得了39个表达差异基因。随机选取120个位点设计引物,进行验证分析,共获得16个有效的多态性标记。
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| 关 键 词： | 大鳞副泥鳅 高通量测序 SNP 多态性标记 引物设计 |
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