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SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用
引用本文:杜晓云,张青林,黄建民,罗正荣.SSAP逆转座子分子标记在柿属植物遗传分析中的应用[J].农业生物技术学报,2010,18(4):682-688.
作者姓名:杜晓云  张青林  黄建民  罗正荣
作者单位:1. 江西省农业科学院园艺研究所,南昌,330200;华中农业大学园艺植物学教育部重点实验室,武汉,430070
2. 华中农业大学园艺植物学教育部重点实验室,武汉,430070
3. 江西省农业科学院园艺研究所,南昌,330200
基金项目:国家自然科学基金,教育部高等学校博士学科点专项科研基金(新教师基金),江西省农业科学院创新基金 
摘    要:对SSAP(特异序列扩增多态性;sequence-specific amplification polymorphism)在部分柿属植物种质鉴定和亲缘关系分析中的应用进行了研究,并对每个SSAP引物单独用于柿属植物遗传分析的性能作了探讨。基于5个逆转座子引物的25对SSAP引物组合在供试28份柿属(Diospyros L.)基因型中共扩增出1300个位点(多态位点93.38%),每对引物平均产生52个位点(含48个多态位点),表明SSAP是一种高多重比例系数(multiplex ratio)和高多态性的标记系统;经SSAP数据的UPGMA聚类和主坐标分析,原产中国、日本的柿种质(D.kakiThunb.)及柿的近缘种各自单独成组,该聚类结果与部分已知亲缘关系的试材十分吻合,表明SSAP技术可用于柿属植物亲缘关系研究。此外,在25对SSAP引物组合中筛选出3对具高信息含量的引物组合,将在柿属植物遗传关系研究中广泛应用。

关 键 词:柿属植物  种质鉴定  亲缘关系  逆转座子  特异序列扩增多态性(SSAP)

Applification of SSAP Retrotransposon-based Molecular Marker for Genetic Analysis of Diospyros spp.(Ebenaceae)
Du Xiaoyun,Zhang Qinglin,Huang Jianmin,Luo Zhengrong.Applification of SSAP Retrotransposon-based Molecular Marker for Genetic Analysis of Diospyros spp.(Ebenaceae)[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2010,18(4):682-688.
Authors:Du Xiaoyun  Zhang Qinglin  Huang Jianmin  Luo Zhengrong
Abstract:
Keywords:
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