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鳜hepcidin cDNA的分子克隆及序列分析
引用本文:刘碧莲,白俊杰,劳海华,叶星,简清.鳜hepcidin cDNA的分子克隆及序列分析[J].中国水产科学,2006,13(6):995-1000.
作者姓名:刘碧莲  白俊杰  劳海华  叶星  简清
作者单位:1. 中国水产科学研究院,珠江水产研究所,中国水产科学研究院,热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380;上海水产大学,生命科学与技术学院,上海,200090
2. 中国水产科学研究院,珠江水产研究所,中国水产科学研究院,热带亚热带鱼类选育与养殖重点开放实验室,广东,广州,510380
基金项目:科技部科技基础条件平台建设计划
摘    要:Hepcidin是近年来发现的一类具有独特性质的抗菌肽,根据C-enBank中收录的鱼类抗菌肽hepcidin的cDNA序列设计一对简并引物,用RT-PCR方法从鳜(Sinipercachuatsi)肝脏组织中克隆到hepcidin的cDNA,并构建pMD18-T-hep-cidin载体进行序列测定和分析。结果表明,该cDNA长为381bp,其中第20-277位是该基因的开放阅读框(ORF),编码86个氨基酸,形成由信号肽(24个残基)、前肽(42个残基)和成熟肽(20个残基)3部分序列组成的前体肽,与已报道的其他鲈形目鱼类hepcidin相比较,核苷酸序列的同源性为72.2%-92.0%,所推导的成熟肽与包括人类在内的其他生物hepcidin成熟肽的同源性在50%-86.4%,都含有8个保守的cys残基,可形成4个链内二硫键。鳜hepcidin cDNA片段的获得为以后的重组表达奠定了实验基础,也为抗菌肽hepcidin家族找到了新的成员。

关 键 词:抗菌肽    cDNA克隆  序列分析
文章编号:1005-8737-(2006)06-0995-06
收稿时间:2006-02-09
修稿时间:2006-04-10

Cloning and sequence analysis of cDNA encoding hepcidin ,an antimicrobial peptide from mandarin fish Siniperca chuatsi
LIU Bi-lian,BAI Jun-jie,LAO Hai-hua,YE Xing,JIAN Qing.Cloning and sequence analysis of cDNA encoding hepcidin ,an antimicrobial peptide from mandarin fish Siniperca chuatsi[J].Journal of Fishery Sciences of China,2006,13(6):995-1000.
Authors:LIU Bi-lian  BAI Jun-jie  LAO Hai-hua  YE Xing  JIAN Qing
Abstract:
Keywords:hepcidin
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