| 大银鱼全基因组简单重复序列标记开发及在不同生态型群体中的检验 |
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| 引用本文： | 唐雪梅,周彦锋,方弟安,罗宇婷,张敏莹,蒋书伦,张希昭,彭飞,尤洋.大银鱼全基因组简单重复序列标记开发及在不同生态型群体中的检验[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2023(3):413-423. |
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| 作者姓名： | 唐雪梅 周彦锋 方弟安 罗宇婷 张敏莹 蒋书伦 张希昭 彭飞 尤洋 |
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| 作者单位： | 1. 南京农业大学无锡渔业学院;2. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目（2020YFD0900500）；;国家现代农业产业技术体系项目（CARS-46）； |
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| 摘 要： | 利用Krait软件对2020年公布的拼接程度更高的大银鱼全基因组中完美型微卫星的分布特征进行分析，并据此开发具有多态性的微卫星DNA（又称简单重复序列）标记。结果显示：在大银鱼全基因组内共获得587 554个完美型微卫星位点，序列总长度为11 803 017 bp，占全基因组长度的2.53%；在6种重复类型的微卫星中，二核苷酸数量最多（401 585个，占比68.35%）。针对微卫星位点设计的99对引物中，有39对具有多态性，选择其中多态性较好的14个微卫星标记分别对大银鱼洄游型群体、陆封型群体及移植型群体中选择的1个具有代表性的群体进行检验，结果表明，多态性较好的14个微卫星标记在3个具有代表性的群体中均能进行有效扩增。对3个群体的遗传多样性和遗传结构进行分析发现，洄游型群体（崇明岛群体）遗传变异丰富（平均期望杂合度为0.614、平均多态信息含量为0.576），与淡水群体太湖群体（陆封型）和连环湖群体（移植型）]分属于2个不同的遗传群组，两者间具有较大的遗传距离和极高的遗传分化水平（遗传分化指数高于0.25,P<0.05）；淡水群体（太湖和连环湖群体）的遗传变异相对匮乏，2个...
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| 关 键 词： | 大银鱼 基因组简单重复序列 生态型群体 遗传分化 |
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