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大鲵Dmrt2基因cDNA的克隆与表达分析
引用本文:许宝红,肖真明,肖调义,陈开健,刘巧林,周 伟,刘 敏,姚一彬.大鲵Dmrt2基因cDNA的克隆与表达分析[J].水产学报,2012,36(8):1179-1184.
作者姓名:许宝红  肖真明  肖调义  陈开健  刘巧林  周 伟  刘 敏  姚一彬
作者单位:湖南农业大学动物科学技术学院,湖南长沙,410128
基金项目:国家自然科学基金项目(No.31040083); 湖南省科技厅攻关项目(No.06NK3049); 湖南省教育厅重点项目(No.07A012)
摘    要:Dmrt2是参与性腺发育最古老的发育基因家族Dmrt家族成员之一,在维持胚胎组织的正常发育、精子的发生、神经系统和感觉器官发育等方面起重要作用。目前在哺乳动物人类、鸟类红原鸡以及水生动物青鳉中都克隆到Dmrt家族成员并证明其与性腺和生长发育的密切相关性。研究采用RACE方法克隆了大鲵Dmrt2基因全长cDNA序列共2 026 bp,开放阅读框长1 581 bp,5′非编码区长58 bp,3′非编码区长387 bp,基因序列提交GenBank的登录号为FJ859987。该基因编码蛋白含526个氨基酸,依生物信息学方法预测该氨基酸为非跨膜蛋白,无信号肽,定位在细胞质内,无分泌蛋白。CDD数据库分析该ORF框翻译的氨基酸,在93~146位含DM保守结构域(c102557)的两个成员pfam00751和smart003010,与哺乳类人mab-3、鸟类红原鸡Dmrt2、两栖类非洲爪蟾Dmrt2和水生类鲐mab-3 DM结构域存在I(异亮氨酸)、R(精氨酸)、M(甲硫氨酸)、T(苏氨酸)、C(半胱氨酸)5个氨基酸的变异;系统进化树分析表明:大鲵Dmrt2与以上四物种首先聚类,据此推测Dmrt基因在进化上高度保守,DM结构域上5个氨基酸的变异对蛋白功能的发挥可能无重要影响。实时荧光定量组织差异表达显示,Dmrt2基因在大鲵的精巢和肌肉组织中高表达,预示该基因可能在性腺发育和生长发育方面起重要作用。

关 键 词:大鲵  Dmrt2  实时荧光定量PCR
收稿时间:2012/1/11 0:00:00
修稿时间:2012/2/13 0:00:00

Molecular cloning and expression analysis of Dmrt2 gene in Andrias davidianus
XU Bao-hong,XIAO Zhen-ming,XIAO Tiao-yi,CHEN Kai-jian,LIU Qiao-lin,ZHOU Wei,LIU Min and YAO Yi-bin.Molecular cloning and expression analysis of Dmrt2 gene in Andrias davidianus[J].Journal of Fisheries of China,2012,36(8):1179-1184.
Authors:XU Bao-hong  XIAO Zhen-ming  XIAO Tiao-yi  CHEN Kai-jian  LIU Qiao-lin  ZHOU Wei  LIU Min and YAO Yi-bin
Institution:(College of Animal Science and Technology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China)
Abstract:
Keywords: Andrias davidianus   Dmrt2  Realreal-time PCR
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