| 我国华东某省HP-PRRSV的分离鉴定及全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 朱紫祥,吴发兴,王晶钰.我国华东某省HP-PRRSV的分离鉴定及全基因组序列分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2010,38(8):25-32. |
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| 作者姓名： | 朱紫祥 吴发兴 王晶钰 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学 动物医学院;中国动物卫生与流行病学中心;西北农林科技大学 动物医学院 |
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| 基金项目： | 国家“十一五”科技支撑计划项目（2007BAD86B04,2007BAD86B05） |
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| 摘 要： | 【目的】从我国华东地区某省3个不同市县的疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)发病猪场送检的病料中分离PRRSV毒株,并对其全基因组进行测序,进而对当前PRRSV流行毒株的分子特征和近几年我国PRRSV毒株的演化特点进行分析。【方法】采集养殖场病死猪的淋巴结和肺脏病料,处理后进行PRRSV的RT-PCR检测。对PRRSV检测呈阳性的病料进行病原分离和免疫荧光试验(IFA)鉴定,测定IFA鉴定呈阳性的PRRSV分离株的TCID50。参照NCBI基因数据库已提交的PRRSVVR-2332、CH-1a、HB-2及JXA1等毒株序列设计6对引物,对所得分离毒株分别进行全基因组序列扩增、测序,并将测序结果与LV、VR-2332、JXA1等国内外16个PRRSV毒株进行序列同源性和进化分析。【结果】试验共分离鉴定获得3株PRRSV毒株,分别命名为SDCXA/2008、SDWF、SDLY。全基因组Blast比对结果表明,这3个分离株均为北美洲型毒株。序列分析发现,3个分离株的全基因组序列与欧洲株的同源性极低(61.6%～61.8%),与2006年前分离的美洲型毒株的同源性较低(86.6%～97.1%),与2006后分离的美洲型毒株同源性较高(98.3%～99.7%)。Nsp2基因在3个易变区中变异最大,ORF5次之,ORF3相对最小;推导氨基酸序列中变异最大的亦为Nsp2。3株PRRSV毒株Nsp2基因推导氨基酸的第481和532～560位处共存在30个氨基酸缺失,与以HUN4、JXA1等为代表的国内高致病性分离株序列的同源性较高,结合进化分析将其均划为与JXA1类似的高致病性猪蓝耳病毒株(HP-PRRSV)。【结论】分离到3株HP-PRRSV毒株,其遗传特征相对稳定,但同时也发生了一定的变异,说明PRRSV还在不断地变异和演化。PRRSV的分布无明显地域性。
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| 关 键 词： | PRRSV 同源性 RT-PCR 进化分析 |
| 收稿时间： | 2010/1/13 0:00:00 |
Isolation,identification and genomic analysis of HP-PRRSV obtained from one province in east China |
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| ZHU Zi-xiang,WU FA-xing,WANG Jing-yu,LI Ping,GAO Xu-lei,ZHANG Yan-xia,ZHANG Zhi,LIU Shuang,LI Xiao-cheng.Isolation,identification and genomic analysis of HP-PRRSV obtained from one province in east China[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2010,38(8):25-32. |
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| Authors: | ZHU Zi-xiang WU FA-xing WANG Jing-yu LI Ping GAO Xu-lei ZHANG Yan-xia ZHANG Zhi LIU Shuang LI Xiao-cheng |
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| Institution: | 1 College of Veterinary Medicine,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China;2 China Animal Health and Epidemiology Center,Qingdao,Shandong 266032,China;3 College of Veterinary Medicine,Xinjiang Agricultural University,Urumchi,Xinjiang 830052,China;4 College of Animal Science and Technology,Qingdao Agricultural University,Qingdao,Shandong 266109,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PRRSV homology RT-PCR phylogenetic analysis |
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