脆木耳转录组EST-SSR标记特征及多态性分析 |
| |
引用本文: | 王艺琴,张素勤,郭豪,田怀志,熊兴伟,刘进平,耿广东.脆木耳转录组EST-SSR标记特征及多态性分析[J].分子植物育种,2024(8):2611-2619. |
| |
作者姓名: | 王艺琴 张素勤 郭豪 田怀志 熊兴伟 刘进平 耿广东 |
| |
作者单位: | 贵州大学农学院 |
| |
摘 要: | 为开发脆木耳EST-SSR标记,本试验从脆木耳转录组测序数据挖掘SSR位点,并设计引物对木耳DNA进行多态性分析,为木耳的遗传育种提供理论基础。结果发现,在脆木耳转录组的52 954条unigene序列中共搜寻到4 600个SSR位点,SSR发生频率为6.85%,分布频率为8.69%。脆木耳SSR位点共包括112种重复基元;其中,二核苷酸和三核苷酸重复为主要类型,占SSR总数的92.86%。三核苷酸重复最多(66.64%),其优势重复单元为CCG/GGC (8.71%)。从设计引物中随机挑选30对进行PCR扩增,6对引物在3份木耳种质中均能扩增出清晰的目标条带。本试验所获得的EST-SSR可为木耳种质资源鉴定、遗传结构分析及遗传图谱构建等提供参考。
|
关 键 词: | 脆木耳 EST-SSR 特征 PCR体系优化 多态性 |
|
|