玉米Dof转录因子的全基因组鉴定和表达模式分析 |
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引用本文: | 闵远昌,叶钰澜,胡欢,贾文静,南文华.玉米Dof转录因子的全基因组鉴定和表达模式分析[J].分子植物育种,2024(8):2437-2447. |
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作者姓名: | 闵远昌 叶钰澜 胡欢 贾文静 南文华 |
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作者单位: | 1. 西北农林科技大学农学院;2. 山西农业大学农学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(No.31771724)资助; |
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摘 要: | 为了研究玉米中Dof转录因子家族功能,本研究利用生物信息方法,在全基因组水平对玉米Dof转录因子进行鉴定,并对其理化性质、系统进化、保守结构域、共线性和表达模式进行了系统分析。结果表明,共有46个玉米Dof转录因子被鉴定到,它们不均等分布在9条染色体上。多序列比对发现所有的ZmDof均具有1个保守的C2-C2单锌指结构域。系统进化分析将Dof分为4个亚组,其中亚组I和III是最大的亚组,均包含有30个水稻、拟南芥、玉米Dof转录因子。共线性分析发现ZmDof与二穗短柄草、水稻、高粱Dof基因分别组成了22、37、37对共线性基因对,说明它们具有很好的基因共线性关系。表达模式分析发现所有的ZmDof基因表现特异性表达,说明它们在植物生长发育阶段发挥着重要作用。本研究结果为进一步分析玉米Dof转录因子家族的功能提供了重要依据。
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关 键 词: | 玉米 Dof转录因子 全基因组鉴定 表达模式 |
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