水稻‘宜香优2115’OsIRT1基因的克隆及生物信息分析 |
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引用本文: | 王建伟,贺晓岚,汤宏,顾太波.水稻‘宜香优2115’OsIRT1基因的克隆及生物信息分析[J].分子植物育种,2024(6):1751-1758. |
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作者姓名: | 王建伟 贺晓岚 汤宏 顾太波 |
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作者单位: | 1. 凯里学院理学院;2. 凯里学院大健康学院 |
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基金项目: | 贵州省科技计划项目([2017]1167); |
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摘 要: | 铁调节转运蛋白(iron-regulated transporter 1, IRT1)是植物从土壤中吸收铁的主要根系转运蛋白,参与植物铁和锌营养吸收过程,也是镉等有毒金属进入植物体内的主要途径。克隆富铁水稻(Oryza sativa L.)中IRT1基因,为研究该基因在植物铁转运过程中的功能提供参考。本研究采用同源克隆法,以富铁水稻品种‘宜香优2115’叶片总RNA为模板,通过RT-PCR获得水稻‘宜香优2115’IRT1基因,命名为OsIRT1-YXY2115,并对其进行生物信息学分析。生物信息分析表明,该基因cDNA编码区长为1 125 bp,编码374个氨基酸,蛋白序列含有9个跨膜结构,编码蛋白分子量为39.06 kD,理论等电点为8.89,溶液中的不稳定指数为45.73,为不稳定蛋白,该蛋白属于锌铁转运蛋白(ZRT/IRT-like protein, Zip)家族成员。序列同源性分析表明,其与已报道的水稻OsIRT1基因(AB070226.1)相似性最高。亚细胞定位预测分析表明,IRT1-YXY2115蛋白定位于细胞质膜中。IRT1-YXY2115基因克隆及其结构、性质与功能的...
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关 键 词: | 水稻(Oryza sativa L.) 铁 锌 OsIRT1基因 生物信息分析 |
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